应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » foldx相关问题
51/1返回列表
查看: 1396  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

阿拉很强大

金虫 (小有名气)

[求助] foldx相关问题

foldx里面的positionScan的意义在哪里？先突变成Ala再突变成自身后，又重新突变成目标氨基酸？这样的过程意义在哪呢？萌新一个，还在学习中，原谅问这个愚蠢的问题。
The way it operates is: first it mutates the selected position to Ala and annotates all neighbour residues; then it mutates the WT residue to itself, and then the neighbours to themselves followed each time by the WT residue to itself. In this way we ensure that when we mutate we will not move any residue that has not been moved in the WT reference. Once this is done, the new WT reference is mutated at the selected position to the target amino acids. To prevent problems, neighbour side chains are only optimized when creating the WT reference after self- mutation, but not when making the individual mutants unless we select a new rotamer for the neighbour.
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2019-08-09 16:47:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿拉很强大

金虫 (小有名气)
我懂了

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
2楼2019-08-12 04:09:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxxx666

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 阿拉很强大 at 2019-08-12 04:09:11
我懂了

可以请教一下foldx的使用方法吗？我不知道为什么打不开，谢谢
赞一下 回复此楼
3楼2020-02-05 18:23:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿拉很强大

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xxxx666 at 2020-02-05 18:23:52
可以请教一下foldx的使用方法吗？我不知道为什么打不开，谢谢...

foldx用cmd的命令行调用打开，如果没有设置环境路径的话就在原来的工作目录下打开cmd窗口就可以调用了。
赞一下 回复此楼
4楼2020-05-29 08:14:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Phama man

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 阿拉很强大 at 2020-05-29 08:14:26
foldx用cmd的命令行调用打开，如果没有设置环境路径的话就在原来的工作目录下打开cmd窗口就可以调用了。...

大佬，请问能具体教一下吗，可有偿

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2022-01-04 11:41:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 阿拉很强大 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-15 5/250 2026-03-15 20:38 by Logic2024
[考博] 欢迎申博同学联系 +3 天道酬勤2026686 2026-03-10 7/350 2026-03-15 19:03 by 天道酬勤2026686
[考研] 304求调剂 +5 小熊joy 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:07 by peike
[基金申请] 现在如何回避去年的某一个专家，不知道名字 +3 zk200107 2026-03-12 6/300 2026-03-14 17:13 by zk200107
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-09 6/300 2026-03-14 02:14 by JourneyLucky
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 271求调剂 +10 生如夏花… 2026-03-11 10/500 2026-03-14 00:35 by 卖报员小雨
[考研] 327求调剂 +4 Ffff03 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:17 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 求调剂（材料与化工327） +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考研] 298求调剂 +3 Vv呀！ 2026-03-10 3/150 2026-03-10 22:40 by 剑诗杜康
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
[考研] 337求调剂 +3 睡醒，。 2026-03-09 3/150 2026-03-09 10:02 by 求调剂zz
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭