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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】大家帮忙看看gromacs的结果，这样算平衡了吗？
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] 【求助】大家帮忙看看gromacs的结果，这样算平衡了吗？

我用gromacs做一个蛋白-配体的模拟，想得到蛋白-配体间的作用能。我查看了potential, toal_energy , temperature, pressur，全部都很稳定，平衡的很好。

但是我想要的coul(SR):protein-lig和LJ(SR):protein-lig作用项却看起来不是很好，大家帮我看一下，这样算平衡了吗？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:45 ]
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1楼 2009-05-30 12:44:52
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xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gwdavid(金币+1,VIP+0):3q 5-31 11:55
你要的性质没有平衡，不能用作接下来的计算
赞一下(11人) 回复此楼
2楼2009-05-31 08:49:06
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