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ranjw

金虫 (小有名气)

[交流] cif问题求助

本人通过网上检查了cif,发现有很多问题,请高手指教,望祥细点,具体怎样加命令。
ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry .....         95 PerFi
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent    N     Ueq(max)/Ueq(min) ...       3.76 Ratio
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    N2     --  C5      ..       7.76 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    N3     --  C5      ..      14.88 su   
PLAT341_ALERT_3_B Low Bond Precision on C-C Bonds (x 1000) Ang ...         17
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wmt1447

荣誉版主 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不是很清楚啊  帮你顶起来
[img]http://www.discuz.net/images/logo.gif[/img]
2楼2009-05-29 15:36:00
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monoclinic

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry .....         95 PerFi
有95个伪对称,可能是空间群错了。
空间群改过来,后面的问题也许就没有了。
3楼2009-05-29 16:41:27
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huihuijing6303

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
很有可能是空间群定错了,你重新算一下。
4楼2009-05-29 17:03:02
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ranjw

金虫 (小有名气)

我按楼主的重新做了一下,出现上述错误时是电脑自动默认的非心空间群,此时CFOM=0.026,现在我人为改为有心空间群,CFOM=0.15,请问这样改是否正确?如正确,出现了下列新错误,又该怎么改?(我是初学者,望尽量详细点解答,好多命令我还不懂)

Large Non-Solvent    N     Ueq(max)/Ueq(min) ...       4.85 Ratio
PLAT242_ALERT_2_A Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for         C5     
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......          1      
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C3     --  C4      ..       8.59 su
5楼2009-05-30 19:13:27
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lanmao20

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-1 18:45
ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry .....         95 PerFi   空间群应该是有心的,解析完用palton升一下空间群应该就可以了。
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent    N     Ueq(max)/Ueq(min) ...       3.76 Ratio  N原子无序,可能指认原子错误,也有可能需要进一步精修无序
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    N2     --  C5      ..       7.76 su   貌似偏差有点问题,用DELU命令试试,可能会解决
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    N3     --  C5      ..      14.88 su   同上
PLAT341_ALERT_3_B Low Bond Precision on C-C Bonds (x 1000) Ang ...         17   检查一下所有的C-C键长,貌似你的精度不够,是不是用了降低精度的命令之类的,键长可以重新固定一下,这个错误不知道具体是什么原因,所以不知道该怎么解决,呵呵
6楼2009-06-01 14:39:07
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