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zmcwangyang

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 求助,用vina做分子对接才能同时对接多个配体小分子 已有3人参与

新人求助,用vina做分子对接时怎么才能同时对接多个配体小分子,是更改conf.txt的内容吗?还是有其他的方法,谢谢
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一代米哟

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主的意思是多个配体同时结合在口袋里吧?可以百度搜索【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK6)】计算教程,算完之后点击按钮,合成复合物,再用该复合物作为受体,对接新的配体。如此反复,就可以得到多个配体同时结合在口袋里的结果了。不过,这时候的打分是新配体与复合物的结合力,不是所有配体与蛋白的结合力之和。要想得到后者,还需要把对接后的配体再次做一个打分评价。详情可以咨询一下教程作者。
12楼2021-12-03 11:17:18
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therotyonth

金虫 (正式写手)

2楼2019-07-27 21:24:00
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zmcwangyang

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by therotyonth at 2019-07-27 21:24:00
用shell脚本

你好,请问一下shell脚本怎么写呢?
3楼2019-07-27 21:28:24
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cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我现在用一个平台,里面有vina对接,可以多个配体同时对接一个蛋白,百度搜索殷赋云计算平台
4楼2019-12-25 11:17:51
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