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zmcwangyang

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] 求助，用vina做分子对接才能同时对接多个配体小分子已有3人参与

新人求助，用vina做分子对接时怎么才能同时对接多个配体小分子，是更改conf.txt的内容吗？还是有其他的方法，谢谢

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1楼2019-07-27 20:00:47

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一代米哟

新虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

楼主的意思是多个配体同时结合在口袋里吧？可以百度搜索【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK6)】计算教程，算完之后点击按钮，合成复合物，再用该复合物作为受体，对接新的配体。如此反复，就可以得到多个配体同时结合在口袋里的结果了。不过，这时候的打分是新配体与复合物的结合力，不是所有配体与蛋白的结合力之和。要想得到后者，还需要把对接后的配体再次做一个打分评价。详情可以咨询一下教程作者。