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[交流]
求助：CF3基团无序的精修问题
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最近有一个大结构，里面很多的CF3基团，都是要无序处理的，头大了，问题很多： 1. afix 128 1.39 这个指令是怎么用的，文献上说是可以保证无序的基团相互间的角度为60度，特别适用于CF3的无序，可怎么我一用就提示原子间连接错误呢？大致的意思是中间的C原子不能同时和6个F连接。以下是我的INS文件 C1E 1 -0.086324 -0.311164 -0.376938 11.00000 0.06013 0.04458 = 0.03331 0.01585 0.02770 0.03061 AFIX 128 1.39 F1E 4 -0.0084 -0.3068 -0.3752 21.00000 0.03787 0.20078 = 0.03774 0.02837 0.00682 0.04205 F2E 4 -0.0767 -0.3460 -0.4217 21.00000 0.42765 0.05775 = 0.11208 -0.02146 0.18502 -0.02698 F3E 4 -0.1203 -0.2850 -0.4381 21.00000 0.08367 0.14441 = 0.03857 0.04804 0.02691 0.06956 F1E' 4 -0.0148 -0.3183 -0.3798 -21.00000 0.03787 0.20078 = 0.03774 0.02837 0.00682 0.04205 F2E' 4 -0.1154 -0.3446 -0.4387 -21.00000 0.42765 0.05775 = 0.11208 -0.02146 0.18502 -0.02698 F3E' 4 -0.1337 -0.2943 -0.4462 -21.00000 0.08367 0.14441 = 0.03857 0.04804 0.02691 0.06956 AFIX 0 其中两组原子是根据LST文件中的信息分裂出来的。 2。如果同一个结构中多组无序，在PART指令中的是否下面依次是31，-31 ，41，-41.。。。。？ 3.SHELXL说明书中关于多组无序的处理该怎么理解？红字部分都是我不理解的 SAME_CF3 C1 > F3 EXYZ C1_1 C1_2 EADP C1_1 C1_2 PART 1 RESI 1 CF3 C1 1 xyz 21.0000 … F1 3 xyz 21.000 …. F2 3 xyz 21.000 …. F3 3 xyz 21.000 …. RESI 2 CF3 PART 2 C1 1 xyz -21.000 … F1 3 xyz -21.000 …. F2 3 xyz -21.000 …. F3 3 xyz -21.000 …. PART 0 RESI 0 这是一组的处理 其余的几组无序呢？直接照写就可以了吗？ [ Last edited by sshadow on 2009-5-25 at 16:35 ] |
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2楼2009-05-25 22:30:34