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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 理论与计算方法 » ECD 计算经验小结
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72219074

木虫 (小有名气)

[交流] ECD 计算经验小结

ECD计算在确定手性化合物的绝对构型方面，已经是非常成熟的方法了，即使影响因子非常低的杂志也要求计算ECD，从而确定绝对构型。我们长期为各大高校、科研单位提供这类计算服务，积累了一些经验，分享如下：
1.构象搜索时必须的，一般阈值设为3.0即可。
2.必须结合NOESY挑选合适的构象，不然计算结果跟实验结果可能不吻合。
3.优化时用常规基组如6-31G*就可以满足。
4.计算激发态时，TD-B3LYP，真空条件多很多体系都能得到比较好结果，有个别体系，需要尝试不同的方法，比如CAM-B3LYP，或者加上溶剂模型。
5.有些体系不管怎样计算，都很难吻合的很好，这时候可以适当提高能量阈值，比如设为5.0kcal/mol。
最后，欢迎感兴趣的同行交流。Thanks a lot.
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林利彬1992 07002962 07002962 yxpv3202

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1楼 2019-06-25 09:05:45
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cngdkpmg

铁虫 (小有名气)
★
72219074(金币+5): 谢谢参与
构象搜索要看结构类型，简单的结构往往需要降低RMSD阈值。怎么计算都不好的情况是有的，但不多，主要还是构象搜索得不好。百度搜索【构象搜索教程 小分子构象搜索】。有三种搜索方式，针对不同类型的结构。
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47楼2021-11-18 16:13:10
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Oliy

新虫 (正式写手)
★
72219074(金币+5): 谢谢参与
好东西

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13楼2019-06-26 12:06:00
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youngen7楼
2019-06-26 07:31   回复  
72219074(金币+5): 谢谢参与
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紫然若依11楼
2019-06-26 08:17   回复  
72219074(金币+5): 谢谢参与
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