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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 理论与计算方法 » ECD 计算经验小结
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72219074

木虫 (小有名气)

[交流] ECD 计算经验小结

ECD计算在确定手性化合物的绝对构型方面，已经是非常成熟的方法了，即使影响因子非常低的杂志也要求计算ECD，从而确定绝对构型。我们长期为各大高校、科研单位提供这类计算服务，积累了一些经验，分享如下：
1.构象搜索时必须的，一般阈值设为3.0即可。
2.必须结合NOESY挑选合适的构象，不然计算结果跟实验结果可能不吻合。
3.优化时用常规基组如6-31G*就可以满足。
4.计算激发态时，TD-B3LYP，真空条件多很多体系都能得到比较好结果，有个别体系，需要尝试不同的方法，比如CAM-B3LYP，或者加上溶剂模型。
5.有些体系不管怎样计算，都很难吻合的很好，这时候可以适当提高能量阈值，比如设为5.0kcal/mol。
最后，欢迎感兴趣的同行交流。Thanks a lot.
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林利彬1992 07002962 07002962 yxpv3202

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1楼 2019-06-25 09:05:45
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Oliy

新虫 (正式写手)
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好东西

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13楼2019-06-26 12:06:00
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bobcanada

至尊木虫 (文坛精英)
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ding
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15楼2019-06-27 10:43:45
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xiao13572468

禁虫 (正式写手)
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16楼2019-06-27 10:52:38
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zuiaixuexi

至尊木虫 (文坛精英)
祝你成功
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33楼2019-07-01 09:10:40
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匿名

用户注销 (初入文坛)
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35楼2019-08-08 11:35:36
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C帘卷西风

禁虫 (正式写手)
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36楼2019-08-16 14:45:25
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gxyang

银虫 (小有名气)
★
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我们想进行ECD计算，请介绍下你们的服务方式，谢谢！

可以邮件：gxyang@fudan.edu.cn
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39楼2019-12-01 11:40:41
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蓉蓉番薯

禁虫 (文坛精英)
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41楼2020-10-06 17:16:48
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赵闲生

铁虫 (初入文坛)
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44楼2021-01-14 17:46:16
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yxpv3202

新虫 (小有名气)
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送红花一朵
谢谢。
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45楼2021-09-03 09:01:57
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chenhuanlong

禁虫 (文学泰斗)
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46楼2021-09-06 10:52:17
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cngdkpmg

铁虫 (小有名气)
★
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构象搜索要看结构类型，简单的结构往往需要降低RMSD阈值。怎么计算都不好的情况是有的，但不多，主要还是构象搜索得不好。百度搜索【构象搜索教程 小分子构象搜索】。有三种搜索方式，针对不同类型的结构。
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47楼2021-11-18 16:13:10
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chenhuanlong

禁虫 (文学泰斗)
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48楼2021-11-20 17:08:03
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time882楼
2019-06-25 09:42   回复  
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fingerlake3楼
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159413916674楼
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muzi01045楼
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nono20096楼
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youngen7楼
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zhoujian20118楼
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miaojiabing9楼
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xautldhldh10楼
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紫然若依11楼
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欣哲-21112楼
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paperhunter14楼
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林利彬199218楼
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梦青诗19楼
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hmei20楼
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tangbohejin26楼
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曦兮思宇27楼
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lantianmei29楼
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小蘑菇づ30楼
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木瓜少爷31楼
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ckxbear32楼
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wang686wang38楼
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蓉蓉番薯40楼
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ro1142楼
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蓉蓉番薯43楼
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新生mqh49楼
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