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dfjk-123

新虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】dock 5 打分函数的调节

我正在使用dock 5.1进行蛋白质和小分子的对接,但是对接后的结构总是和晶体结构不一样,请问这是什么问题,应该修改打分函数中的哪一个参数?dock.in中哪些参数会对打分有大的影响?应该如何调节?

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:53 ]
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wendaoliuxu

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有点疑问

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q68(金币+1,VIP+0):经验分享! 6-5 08:08
对接后的结构和晶体结构不一样,什么意思?
dock的打分一般都要经过复杂调节优化的,这是它的缺点,也是优点啊。
O(∩_∩)O哈哈~  有时调着调着就出来了……
whowantstobemy"ErwinSchrodinger'sCat"?
2楼2009-06-04 22:19:05
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