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liwenliang

金虫 (正式写手)

[交流] 请教:cif文件中,无序原子键长键角信息缺失?

如题:
我的一个数据中,含有如下结构单元:s1 — c1 — c2 — s2, 其中c2是无序的,我将c2按无序处理,投到acta中,编辑回信如下:
   Please re-refine the crystal structure with using PART instruction for
   C1 & C2 atoms, not only for C2. Moreover, use SADI instruction for
   sp3-sp3 bond type C1a-C2a & C1b-C2b bonds.
这里不明白为何c1不无序也要做part命令?

然后我将ins文件加了如下命令:
exyz c1 c1'
eadp c1 c1'
sadi c1 c2
sadi c1' c2'
及part命令            

之后发现缺少与c1有关的键长键角信息:C1-C2, S1-C1 和键角
S1-C1-C2, C1-C2-S2

而C1'-C2', S1-C1' 和键角 S1-C1'-C2', C1'-C2'-S2的信息都有,请问这里又是为什么?

我哪里出了错误,该怎么做?希望能得到高手指点!

[ Last edited by liwenliang on 2009-5-24 at 16:40 ]
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liwenliang(金币+9,VIP+0): 5-25 08:20
因为C1, C1'被你限制exyz,eadp,在同一位置, 所以只计算一套键长,键角,很正常.
xi2004-emuch@163.com
2楼2009-05-24 23:28:30
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xuanyuanjie

至尊木虫 (职业作家)

木虫隐修士


liwenliang(金币+1,VIP+0): 5-25 08:20
长见识了!
我思故我在,神与我同在。
3楼2009-05-25 01:30:30
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