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yyx19840628木虫 (著名写手)
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【求助】forcite退火
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我用的是MS中的forcite模拟退火过程。 在文献中看到如下描述。 we carried out high temperature annealed MD simulations starting at 1000K (2 ps) annealing to 0K (10 ps). The temperature of 1000K is necessary to enable the molecule to overcome energy barriers between different conformations and to prevent the system from getting stuck in a particular region of the conformational space. 不清楚这个1000K和0K是不是指初始温度和最后的温度?Forcite里面好像只有一个初始温度的设定?并没有终止温度呐? 还有那个2ps和10ps是指什么?在Forcite里面有对应的设置吗? |
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fu19871111
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5楼2010-03-24 09:44:35
yongbinz
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fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流! 5-23 17:10
yyx19840628(金币+1,VIP+0):我知道是初始和末温度,只是forcite里面没有对应选项……想问的主要是这个…… 5-25 07:55
yyx19840628(金币+1,VIP+0):1000K和0K分别是指从高温跑到低温,你先在1000K跑下动力学,再间隔一定温度,跑动力学,直到降至0K,再跑动力学。意思是模拟实际的退火过程。 5-27 09:32
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流! 5-23 17:10
yyx19840628(金币+1,VIP+0):我知道是初始和末温度,只是forcite里面没有对应选项……想问的主要是这个…… 5-25 07:55
yyx19840628(金币+1,VIP+0):1000K和0K分别是指从高温跑到低温,你先在1000K跑下动力学,再间隔一定温度,跑动力学,直到降至0K,再跑动力学。意思是模拟实际的退火过程。 5-27 09:32
| 1000K和0K分别是指从高温跑到低温,你先在1000K跑下动力学,再间隔一定温度,跑动力学,直到降至0K,再跑动力学。意思是模拟实际的退火过程。 |
2楼2009-05-22 23:12:56
yyx19840628
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