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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

[交流] 【求助】forcite退火

我用的是MS中的forcite模拟退火过程。
在文献中看到如下描述。
we carried out high temperature
annealed MD simulations starting at 1000K (2 ps)
annealing to 0K (10 ps). The temperature of 1000K
is necessary to enable the molecule to overcome energy
barriers between different conformations and to
prevent the system from getting stuck in a particular
region of the conformational space.
不清楚这个1000K和0K是不是指初始温度和最后的温度?Forcite里面好像只有一个初始温度的设定?并没有终止温度呐?
还有那个2ps和10ps是指什么?在Forcite里面有对应的设置吗?
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

我知道是初始和末温度,只是forcite里面没有对应选项……想问的主要是这个……
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
3楼2009-05-25 07:54:49
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yongbinz

金虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流! 5-23 17:10
yyx19840628(金币+1,VIP+0):我知道是初始和末温度,只是forcite里面没有对应选项……想问的主要是这个…… 5-25 07:55
yyx19840628(金币+1,VIP+0):1000K和0K分别是指从高温跑到低温,你先在1000K跑下动力学,再间隔一定温度,跑动力学,直到降至0K,再跑动力学。意思是模拟实际的退火过程。 5-27 09:32
1000K和0K分别是指从高温跑到低温,你先在1000K跑下动力学,再间隔一定温度,跑动力学,直到降至0K,再跑动力学。意思是模拟实际的退火过程。
2楼2009-05-22 23:12:56
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fu19871111

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yyx19840628 at 2009-05-25 07:54:49:
我知道是初始和末温度,只是forcite里面没有对应选项……想问的主要是这个……

我也想知道啊   还有里面的压力什么的怎么设置?
4楼2010-03-24 09:43:11
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fu19871111

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by fu19871111 at 2010-03-24 09:43:11:

我也想知道啊   还有里面的压力什么的怎么设置?

那个mid-cyle temperature 好像就是末温度
5楼2010-03-24 09:44:35
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