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wwxxxin

铜虫 (初入文坛)

[求助] 氨氧化细菌pcr 已有1人参与

氨氧化细菌用aomA1F-amoA2R总是p不出来,弥散状。已确定模板,酶,体系没有问题(同样的样品,酶,体系,Arch amoA可以扩增出来),参考过(Li-Mei Zhang 2010)的Touchdown反应程序。退火温度梯度50-60度也设置过。问题还有可能出现在哪里?
CTO189f-CTO654r(KOWALCHUK,G. A.  1997)可以做氨氧化细菌的引物吗?是否会好一些?
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wwxxxin

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by kshdd at 2019-06-04 10:13:55
那就是最后一种可能:你的引物跟你的菌对不上,换引物吧

不会的,样品是土壤的总DNA。

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8楼2019-06-05 06:57:54
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梧桐清雨

新虫 (小有名气)

AOB_amoA一般是很容易就p出来的,是不是你找的引物的问题?

发自小木虫Android客户端
2楼2019-05-31 22:35:59
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wwxxxin

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 梧桐清雨 at 2019-05-31 22:35:59
AOB_amoA一般是很容易就p出来的,是不是你找的引物的问题?

一点儿都p不出来,我都怀疑是不是公司引物弄错了?

发自小木虫Android客户端
3楼2019-06-02 11:07:52
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梧桐清雨

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小冀-: 金币+3, 鼓励回帖交流,有帮助 2019-06-03 09:12:14
我都用1F/2R的引物,很容易出带的,除非你的不是AOB,或者是γ_变形杆菌的。还有你的退火时间有没有问题

发自小木虫Android客户端
4楼2019-06-02 22:26:52
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