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shanks2017

铁虫 (小有名气)

[求助] 追踪原子

想通过追踪原子坐标来计算泊松比,看了手册可以用dump命令输出原子坐标,关键是如何知道所选取的原子id?知道原子id后怎样输出它的坐标呢?
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kexing46

金虫 (正式写手)

dump可以custom选择输出指定group的id和xyz坐标

发自小木虫Android客户端

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2楼2019-05-30 13:47:56
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shanks2017

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by kexing46 at 2019-05-30 13:47:56
dump可以custom选择输出指定group的id和xyz坐标

你好,谢谢你的回复,我之前逛论坛看到有人发了下面这个,说是输出原子坐标的,分组然后输出原子坐标,他中间加了compute csel gsel com,这个的意思应该是计算原子坐标,但是我在手册上并没有找到这个相关的命令,你知道这个是什么意思吗?你说的输出指定原子的坐标跟这个一样吗?
group gsel id 1
compute csel gsel com
variable x equal c_csel[1]
variable y equal c_csel[2]
variable z equal c_csel[3]
3楼2019-05-31 09:57:44
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