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怎么计算重金属。 已有1人参与
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请问各位虫友。能和我讲述一下计算重金属时候的口令么？以及步骤。小白向你鞠躬了。比如模拟计算三价铁离子和水的作用。 发自小木虫Android客户端 |
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paramecium86
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【答案】应助回帖
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zhou2009: 金币+8 2019-05-25 08:50:06
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zhou2009: 金币+8 2019-05-25 08:50:06
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给你个例子，例如算一个带Fe的分子 的结构优化频率计算 如果想让Fe是SDD基组，其他是6-311g(d,p)，则输入文件为 %nproc=16 %mem=10GB %chk=1.chk #p opt freq b3lyp/genecp <<<<<<<关键词部分 b3lyp泛函 全电子/赝势混合基组 <<<<<<<<<<一定要空一行 Title Card Required <<<<<<<<<<一定要空一行 0 2 <<<<<<<电荷和多重度，之下是分子坐标 这个坐标可以把你的分子用gview画出来 然后让gview给出个坐标直接复制过来用就行。 O 1.23641237 1.02449231 0.48357982 O 3.79340942 -0.41974574 0.40393821 C 1.28546627 -0.30626188 0.36753494 N 2.59517275 -1.04941707 -0.02178549 H 2.57396972 -1.96339548 0.38342297 C 0.00854381 -1.12716700 0.62673335 H 0.27531773 -2.09151263 1.00590241 H -0.60292444 -0.61901871 1.34282824 Fe 2.53412498 0.45179272 -1.25580654 C -0.77227654 -1.29148902 -0.69042946 H -1.65948890 -1.86185816 -0.51033706 H -1.03905046 -0.32714339 -1.06959852 H -0.16080829 -1.79963731 -1.40652435 <<<<<<<<<<一定要空一行 Fe 0 <<<<<<<先定义电子基组部分 最后要加一个0 SDD **** C H O N 0 6-311g(d,p) **** <<<<<<<<<<每个不同电子基组之间要用****作为分隔符，写完最后一个电子基组也要写 <<<<<<<<<<一定要空一行 Fe 0 <<<<<<<<<<<这里开始是赝势部分 最后也要写个0 SDD <<<<<<<<<这里一定要有个空行 |
4楼2019-05-24 22:24:15
paramecium86
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5楼2019-05-25 12:16:03
