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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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冤big头

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么计算重金属。 已有1人参与

请问各位虫友。能和我讲述一下计算重金属时候的口令么？以及步骤。小白向你鞠躬了。比如模拟计算三价铁离子和水的作用。

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1楼 2019-05-22 20:16:26
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paramecium86

版主 (著名写手)
你要知道的具体是什么呢？是要问算重金属和轻原子的不同么？那基本上最大的不同就是混合基组设置  还有多重度不太容易确定的问题。其他的在input写法上和算一般的轻原子区别不太大的
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2楼2019-05-24 09:50:36
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冤big头

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-05-24 09:50:36
你要知道的具体是什么呢？是要问算重金属和轻原子的不同么？那基本上最大的不同就是混合基组设置  还有多重度不太容易确定的问题。其他的在input写法上和算一般的轻原子区别不太大的

我想问的就是。用密度泛函理论计算重金属的一个具体口令是啥

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3楼2019-05-24 16:49:18
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+8 2019-05-25 08:50:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by 冤big头 at 2019-05-24 03:49:18
我想问的就是。用密度泛函理论计算重金属的一个具体口令是啥
...

给你个例子，例如算一个带Fe的分子 的结构优化频率计算 如果想让Fe是SDD基组，其他是6-311g(d,p)，则输入文件为

%nproc=16
%mem=10GB
%chk=1.chk
#p opt freq b3lyp/genecp   <<<<<<<关键词部分  b3lyp泛函 全电子/赝势混合基组
                           <<<<<<<<<<一定要空一行
Title Card Required
                           <<<<<<<<<<一定要空一行
0 2                 <<<<<<<电荷和多重度，之下是分子坐标 这个坐标可以把你的分子用gview画出来 然后让gview给出个坐标直接复制过来用就行。
O                  1.23641237    1.02449231    0.48357982
O                  3.79340942   -0.41974574    0.40393821
C                  1.28546627   -0.30626188    0.36753494
N                  2.59517275   -1.04941707   -0.02178549
H                  2.57396972   -1.96339548    0.38342297
C                  0.00854381   -1.12716700    0.62673335
H                  0.27531773   -2.09151263    1.00590241
H                 -0.60292444   -0.61901871    1.34282824
Fe                 2.53412498    0.45179272   -1.25580654
C                 -0.77227654   -1.29148902   -0.69042946
H                 -1.65948890   -1.86185816   -0.51033706
H                 -1.03905046   -0.32714339   -1.06959852
H                 -0.16080829   -1.79963731   -1.40652435
               <<<<<<<<<<一定要空一行
Fe 0           <<<<<<<先定义电子基组部分 最后要加一个0
SDD
****
C H O N 0
6-311g(d,p)
****        <<<<<<<<<<每个不同电子基组之间要用****作为分隔符，写完最后一个电子基组也要写
            <<<<<<<<<<一定要空一行
Fe 0        <<<<<<<<<<<这里开始是赝势部分 最后也要写个0
SDD
            <<<<<<<<<这里一定要有个空行
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4楼2019-05-24 22:24:15
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冤big头

新虫 (小有名气)
谢谢大佬

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5楼2019-05-25 12:16:03
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冤big头

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-05-24 22:24:15
给你个例子，例如算一个带Fe的分子 的结构优化频率计算 如果想让Fe是SDD基组，其他是6-311g(d,p)，则输入文件为

%nproc=16
%mem=10GB
%chk=1.chk
#p opt freq b3lyp/genecp   &lt;&lt;&lt;& ...

谢谢大佬

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6楼2019-05-25 12:16:21
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