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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » Autodock如何设置对接位点啊？急急
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萌翻啊

新虫 (小有名气)

[求助] Autodock如何设置对接位点啊？急急 已有1人参与

请问，Autodock如何设置对接位点啊？？
就是，我有一个配体A，我查文献知道第299位是这个配体的对接位点。那么在ADT里，怎么选中这个299位，让它成为对接位点呢？如何操作呢？谢谢！！
因为如果不特别设置这个299位的话， ADT对接总是对接不到这个位置上。谢谢。。

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1楼 2019-05-16 20:09:21
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therotyonth

金虫 (正式写手)
设置299的CA原子坐标为盒子中心

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2楼2019-05-17 08:29:56
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mr.sad

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以设置docking区域使得感兴趣的位点被覆盖，具体可以参考http://vina.scripps.edu/tutorial.html
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3楼2019-05-17 11:53:34
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萌翻啊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by therotyonth at 2019-05-17 08:29:56
设置299的CA原子坐标为盒子中心

怎么设置啊，我还是新手，不知道具体怎么操作，你可以告诉我步骤吗？

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4楼2019-05-17 16:40:17
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扯不断

铜虫 (小有名气)
参考这篇文章《如何确定对接口袋》，链接https://mp.weixin.qq.com/s/dXv0Hm6cK3xX2uToPt9HgA
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5楼2019-10-26 11:04:22
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