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samjut

金虫 (小有名气)

[求助] 问下,用MS算聚酰亚胺结构的密度相关的问题

将起始密度设置为0.2,然后构建无定型晶胞,然后结构优化,NPT,NVT,退火,再NPT,之后,密度大概为1.28左右,和实际还是差一点,实际应该是1.35-1.4左右。想问问,我这个操作是否有啥问题呀?dynamic的时候都是选用一个大气压,室温,COMPASSII为力场。
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S-Loser

新虫 (正式写手)

2楼2019-05-14 08:54:27
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samjut

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by S-Loser at 2019-05-14 08:54:27
分子式可以给我发一下吗

就是最常见的PI,Kapton,4,4‘-二氨基二苯醚和均苯四甲酸二酐。20个重复单元为一条链,模拟的时候是一个无定型晶胞5条分子链的。谢谢了~
3楼2019-05-14 09:16:59
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