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奇怪的小胖子

铜虫 (初入文坛)

[求助] 有偿做3D-QSAR 已有1人参与

在对训练集里的小分子进行叠合的时候，我选择活性最好的分子作为模板分子，叠和的也挺好的。之后导入pIC50值计算cosia值然后进行pls分析。但是q方一直小于0.5。有这方面的建模大神么？

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1楼 2019-05-12 12:29:17
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astrozheng

银虫 (小有名气)
不懂。。。最近在搞机器学习预测分子特性。。

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个人签名用英文会没有空格，真是个bug.
2楼2019-05-15 15:51:07
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wph666

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

1）对于训练集分子的选择：要不停地替换训练集里的分子，每次替换要记录可能引起的交叉验证值上升或下降，保留引起该值上升的，剔除引起q2 下降的，逐渐逼近q2大于0.5
2）叠合骨架选择：首选活性最大的分子为模板分子，其次选择骨架时，应尽量将药效团选入。
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3楼2019-06-26 19:45:50
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wph666

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

还有，选择训练集时各个数量级活性的分子均要有代表
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4楼2019-06-26 19:47:56
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