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zhangyujin

铜虫 (正式写手)

[求助] autodock对接以后蛋白质和小分子中都没有氢原子

请问autodock对接以后蛋白质和小分子中都没有氢原子,是需要手动将对接后的体系加氢再输出结构吗?
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therotyonth

金虫 (正式写手)

分子对接确实是没有非极性氢原子的,使用原始蛋白pdb即可。小分子可以自动添加。

发自小木虫IOS客户端
2楼2019-05-10 10:39:15
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zhangyujin

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by therotyonth at 2019-05-10 10:39:15
分子对接确实是没有非极性氢原子的,使用原始蛋白pdb即可。小分子可以自动添加。

你好,谢谢回复。但是我想输出蛋白和小分子对接以后的整个体系的结构,打开对接结果显示受体和配体都是没有H的,这样的话是没法再导入原始蛋白的,而且你说的小分子自动添加H我也没有找到,你想表达的应该是手动加H吧?
Hardworking!!
3楼2019-05-10 18:45:14
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therotyonth

金虫 (正式写手)

4楼2019-05-12 00:06:28
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