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再见苏摩

银虫 (初入文坛)

[交流] 今天提的叶子的RNA,大侠看看

感觉降解比较厉害,想顺便问下,28S 18S 5S 在DNAmarker相对应的什么地方
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amilie030312

金虫 (正式写手)

不管动物还是植物如果没有污染的话提出来的RNA都应该是三条带的,28S:18S:5S,如果效果很好也没有降解,三条带应该都有,并且28S的亮度是18S的1.8-2倍,但多半没人能真正提出来这样的效果,因为整个过程中肯定会多少降解一些的,5S如果同Trizol来提不一定每次都有,会丢失掉,如果不做小RNA的实验,没有5S也无所谓的。如果是植物不做抽提之前的处理效果好就应该还有16S那里的一条条带的,之前去除过植物污染的一般就没有了。如果不愿意跑变性琼脂糖来检测只跑普通的琼脂糖检测的话,建议200V跑2-3分钟,小槽子来跑,跑完了马上照相,跑之前所有器皿去RNA酶处理一下,尽量减少降解。而跑普通琼脂糖的时候如果RNA有拖带有两种情况,一种是可能有DNA污染,或者可能是降解了全部的各个S都连在了一起。
12楼2009-05-20 12:40:16
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再见苏摩

银虫 (初入文坛)

标记写错了,最上面的marker是5000bp
2楼2009-05-19 15:38:49
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
再见苏摩(金币+2,VIP+0):谢谢 5-20 09:06
动物的一般是4.5和1.9kb
植物的偏小,但具体就不知道在哪里
这种质量的RNA,做普通RT-PCR还是可以的
3楼2009-05-19 16:33:17
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cofe

金虫 (小有名气)

已经不错了,稍微一点点拖尾。叶片RNA由于含叶绿体,所以28S下面应该是3条带,不包括5.8S的带。
4楼2009-05-19 17:43:59
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