24小时热门版块排行榜    

查看: 1497  |  回复: 4
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wmwman306

禁虫 (著名写手)

[交流] 求Mantel test(Mantel检测)方法

“用Mantel检验作进一步分析表明,在相对较大的尺度上,大针茅的遗传分化与地理距离相关极显著(g>g 0.05);而在相对较小的尺度上(白音锡勒牧场8个种群),相关不显著(g        -----------《内蒙古中东部草原大针茅的种群遗传分化》摘要的一部分

请教高手:
      1. Mantel test(Mantel检测)采用什么软件进行?
      2.有说明书或者详细计算过程吗?能否给与帮助,或给予例子演示。本人不胜感激!

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmwman306

禁虫 (著名写手)

“用Mantel检验作进一步分析表明,在相对较大的尺度上,大针茅的遗传分化与地理距离相关极显著(g>g 0.05);而在相对较小的尺度上(白音锡勒牧场8个种群),相关不显著(g        -----------《内蒙古中东部草原大针茅的种群遗传分化》摘要的一部分

请教高手:
      1. Mantel test(Mantel检测)采用什么软件进行?
      2.有说明书或者详细计算过程吗?能否给与帮助,或给予例子演示。本人不胜感激!

    我的具体情况是有10个不同地区的同一个种名的ISSR数据,还有10个种的地理采集区的经度和纬度值。想看看分子距离和地理距离的相关性。
     谢谢各位帮忙!
4楼2009-05-20 10:46:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

ustcrat

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
wmwman306(金币+5,VIP+0):还是谢谢你!做mantel test不知道你会不会,Ntsys软件里我没找到这个功能,CANOCO这个软件我不试了,我用TFPGA软件就能做,也刚看到有这个功能。 5-23 06:38
CANOCO可以进行简单的M测验,R程序包可以进行偏R测验

Mantel test在计算两个矩阵之间的相关性。当有三个彼此相关的矩阵时,其中的任两个矩阵之间就可能存在partial correlation;partial Mantel test即在计算该partial correlation。 NTSYS v2.10可以进行

[ Last edited by ustcrat on 2009-5-19 at 14:21 ]
2楼2009-05-19 14:19:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmwman306

禁虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by ustcrat at 2009-5-19 14:19:
CANOCO可以进行简单的M测验,R程序包可以进行偏R测验

Mantel test在计算两个矩阵之间的相关性。当有三个彼此相关的矩阵时,其中的任两个矩阵之间就可能存在partial correlation;partial Mantel test即在计算该 ...

这些我在网上见过,不过还是谢谢你!费心了
3楼2009-05-19 14:22:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmwman306

禁虫 (著名写手)

做Mantel test(Mantel检测)方法的方法很多,TFPGA软件就能做,还真是求人不如求己啊。

     撤消求助!
5楼2009-05-23 06:35:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 332求调剂 +3 ydfyh 2026-03-17 3/150 2026-03-19 10:14 by 功夫疯狂
[考研] 274求调剂 +6 S.H1 2026-03-18 6/300 2026-03-19 09:34 by 花店相见
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业(081702)315分求调剂 +10 yangfz 2026-03-17 10/500 2026-03-18 20:14 by walc
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 9/450 2026-03-18 15:31 by vgtyfty
[考研] 化学工程321分求调剂 +15 大米饭! 2026-03-15 18/900 2026-03-18 14:52 by haxia
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +8 Ncdx123456 2026-03-13 9/450 2026-03-18 14:40 by haxia
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +4 材化逐梦人 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:22 by 007_lilei
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +4 ioodiiij 2026-03-17 4/200 2026-03-18 12:36 by Linda Hu
[考研] 0854,计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 303求调剂 +4 睿08 2026-03-17 6/300 2026-03-18 11:01 by Iveryant
[考研] 268求调剂 +6 简单点0 2026-03-17 6/300 2026-03-18 09:04 by 无际的草原
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
信息提示
请填处理意见