24小时热门版块排行榜    

查看: 1631  |  回复: 4
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wmwman306

禁虫 (著名写手)

[交流] 求Mantel test(Mantel检测)方法

“用Mantel检验作进一步分析表明,在相对较大的尺度上,大针茅的遗传分化与地理距离相关极显著(g>g 0.05);而在相对较小的尺度上(白音锡勒牧场8个种群),相关不显著(g        -----------《内蒙古中东部草原大针茅的种群遗传分化》摘要的一部分

请教高手:
      1. Mantel test(Mantel检测)采用什么软件进行?
      2.有说明书或者详细计算过程吗?能否给与帮助,或给予例子演示。本人不胜感激!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmwman306

禁虫 (著名写手)

“用Mantel检验作进一步分析表明,在相对较大的尺度上,大针茅的遗传分化与地理距离相关极显著(g>g 0.05);而在相对较小的尺度上(白音锡勒牧场8个种群),相关不显著(g        -----------《内蒙古中东部草原大针茅的种群遗传分化》摘要的一部分

请教高手:
      1. Mantel test(Mantel检测)采用什么软件进行?
      2.有说明书或者详细计算过程吗?能否给与帮助,或给予例子演示。本人不胜感激!

    我的具体情况是有10个不同地区的同一个种名的ISSR数据,还有10个种的地理采集区的经度和纬度值。想看看分子距离和地理距离的相关性。
     谢谢各位帮忙!
4楼2009-05-20 10:46:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

ustcrat

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
wmwman306(金币+5,VIP+0):还是谢谢你!做mantel test不知道你会不会,Ntsys软件里我没找到这个功能,CANOCO这个软件我不试了,我用TFPGA软件就能做,也刚看到有这个功能。 5-23 06:38
CANOCO可以进行简单的M测验,R程序包可以进行偏R测验

Mantel test在计算两个矩阵之间的相关性。当有三个彼此相关的矩阵时,其中的任两个矩阵之间就可能存在partial correlation;partial Mantel test即在计算该partial correlation。 NTSYS v2.10可以进行

[ Last edited by ustcrat on 2009-5-19 at 14:21 ]
2楼2009-05-19 14:19:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmwman306

禁虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by ustcrat at 2009-5-19 14:19:
CANOCO可以进行简单的M测验,R程序包可以进行偏R测验

Mantel test在计算两个矩阵之间的相关性。当有三个彼此相关的矩阵时,其中的任两个矩阵之间就可能存在partial correlation;partial Mantel test即在计算该 ...

这些我在网上见过,不过还是谢谢你!费心了
3楼2009-05-19 14:22:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wmwman306

禁虫 (著名写手)

做Mantel test(Mantel检测)方法的方法很多,TFPGA软件就能做,还真是求人不如求己啊。

     撤消求助!
5楼2009-05-23 06:35:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 4/200 2026-09-01 06:06 by o3EMxHUAQDtS
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 5/250 2026-09-01 05:45 by o3EMxHUAQDtS
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 21:30 by xiangy672
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见