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wmwman306

禁虫 (著名写手)

[交流] 求Mantel test(Mantel检测)方法

“用Mantel检验作进一步分析表明，在相对较大的尺度上，大针茅的遗传分化与地理距离相关极显著(g>g 0.05)；而在相对较小的尺度上(白音锡勒牧场8个种群)，相关不显著(g        -----------《内蒙古中东部草原大针茅的种群遗传分化》摘要的一部分

请教高手：
      1. Mantel test（Mantel检测）采用什么软件进行？
      2.有说明书或者详细计算过程吗？能否给与帮助，或给予例子演示。本人不胜感激！
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1楼 2009-05-19 14:08:32
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ustcrat

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
wmwman306(金币+5,VIP+0):还是谢谢你！做mantel test不知道你会不会，Ntsys软件里我没找到这个功能，CANOCO这个软件我不试了，我用TFPGA软件就能做，也刚看到有这个功能。 5-23 06:38
CANOCO可以进行简单的M测验，R程序包可以进行偏R测验

Mantel test在计算两个矩阵之间的相关性。当有三个彼此相关的矩阵时，其中的任两个矩阵之间就可能存在partial correlation；partial Mantel test即在计算该partial correlation。 NTSYS v2.10可以进行

[ Last edited by ustcrat on 2009-5-19 at 14:21 ]
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2楼2009-05-19 14:19:34
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wmwman306

禁虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ustcrat at 2009-5-19 14:19:
CANOCO可以进行简单的M测验，R程序包可以进行偏R测验

Mantel test在计算两个矩阵之间的相关性。当有三个彼此相关的矩阵时，其中的任两个矩阵之间就可能存在partial correlation；partial Mantel test即在计算该 ...

这些我在网上见过，不过还是谢谢你！费心了
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3楼2009-05-19 14:22:19
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wmwman306

禁虫 (著名写手)
“用Mantel检验作进一步分析表明，在相对较大的尺度上，大针茅的遗传分化与地理距离相关极显著(g>g 0.05)；而在相对较小的尺度上(白音锡勒牧场8个种群)，相关不显著(g        -----------《内蒙古中东部草原大针茅的种群遗传分化》摘要的一部分

请教高手：
      1. Mantel test（Mantel检测）采用什么软件进行？
      2.有说明书或者详细计算过程吗？能否给与帮助，或给予例子演示。本人不胜感激！

    我的具体情况是有10个不同地区的同一个种名的ISSR数据，还有10个种的地理采集区的经度和纬度值。想看看分子距离和地理距离的相关性。
     谢谢各位帮忙！
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4楼2009-05-20 10:46:40
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wmwman306

禁虫 (著名写手)
做Mantel test(Mantel检测)方法的方法很多，TFPGA软件就能做，还真是求人不如求己啊。

     撤消求助！
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5楼2009-05-23 06:35:03
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