| 查看: 1511 | 回复: 5 | ||||
| 当前主题已经存档。 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
yjcmwgk禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
|
[交流]
【求助】关于cubegen的立方区域大小问题
|
|||
|
各位Gaussian高手： 最近计算了一个分子轨道，是反键轨道。在linux下使用的命令如下： cubegen 0 mo=29 xxx.fchk yyy.cube 100 h 但是发现分子轨道图的大小超过了立方区域的大小。如图（isovalue=0.02） Gaussian说明文件中讲到可以通过手工建立输入文件的方法来得到自定义的立方区域，但是语焉不详，不知道如何建立输入文件，并将自己建立的立方格子输入文件加入到cubegen命令中去。此处请教高人指教，非常感谢！ 又及：增大isovalue可以解决问题，但是我不想这样做。我希望的是不改变isovalue的前提下，如何通过增大立方格子的大小来得到完整的轨道图？谢谢各位高手！！ A value of -1 says to read the cube specification from the input stream, according to the following format: IFlag, X0, Y0, Z0 Output unit number and initial point. N1, X1, Y1, Z1 Number of points and step-size in the X-direction. N2, X2, Y2, Z2 Number of points and step-size in the Y-direction. N3, X3, Y3, Z3 Number of points and step-size in the Z-direction. 又又及： 下面的是高斯03使用手册中的话语。我能看懂，但是不会用： IFlag is the output unit number. If IFlag is less than 0, then a formatted file will be produced; otherwise, an unformatted file will be written. If N1<0 the input cube coordinates are assumed to be in Bohr, otherwise, they are interpreted as Angstroms. |N1| is used as the number of X-direction points in any case; N2 and N3 specify the number of points in the Y and Z directions, respectively. Note that the three axes are used exactly as specified; they are not orthogonalized, so the grid need not be rectangular. The value -5 says to read in an arbitrary list of points from standard input. If you enter this input by hand, terminate the input with an end-of-file (i.e., ^D under Unix). Alternatively, you can redirect standard input to a file containing the list of points (do not place a blank line or ^D at the end of the file). [ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-26 at 13:45 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Gaussian |
» 猜你喜欢
2027申博咨询
已经有11人回复
-
寻求CrC2Al的cif文件，感谢
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有104人回复
-
ORCA 纯新手向入门指南0.7版
已经有1人回复
-
哈尔滨工业大学（深圳）绿色合成化学团队招收27年春季或秋季入学的博士生
已经有5人回复
-
【接测试】TPD-TPR、TPO、脉冲吸附、原位红外，电化学原位红外，站内联系
已经有0人回复
-
吉林大学化学学院理论化学研究所刘靖尧教授课题组招收2027级申请考核制博士研究生
已经有0人回复
-
悉尼大学招聘计算催化博士后， 两年合同，10月26号申请截止
已经有5人回复
-
抗菌测试，微生物培养
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
qzhaosdu
金虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1401.6
- 散金: 2052
- 红花: 7
- 帖子: 1969
- 在线: 263.5小时
- 虫号: 493351
- 注册: 2008-01-10
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
6楼2009-06-08 23:04:20
2楼2009-05-16 15:44:09
erylingjet
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 5.372
- 金币: 9933.4
- 散金: 752
- 红花: 2
- 帖子: 2248
- 在线: 241.5小时
- 虫号: 415302
- 注册: 2007-06-28
- 性别: GG
- 专业: 计算化学
3楼2009-05-16 15:44:57
yjcmwgk
禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
- QC强帖: 38
- 应助: 165 (高中生)
- 贵宾: 16.999
- 金币: 556.2
- 散金: 39880
- 红花: 395
- 沙发: 2
- 帖子: 10406
- 在线: 1528.1小时
- 虫号: 448368
- 注册: 2007-11-01
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 科研工具资源
4楼2009-05-16 16:04:05
