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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » pcr产物测序结果怎么比对
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匿名

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1楼 2019-04-01 20:43:21
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守望者047

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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去NCBI数据库里调出你的目的序列存成txt或者FASTA，找一个你用的惯的比对软件，推荐DNAMAN,VectorNTI或者clustalx，导入你的目的序列和测序结果里面.seq后缀的那个文件进行比对，保存比对结果。如果不知道你p出的是什么序列，可以用NCBI提供的BLAST功能，搜索看看和哪个基因序列相似度高，祝实验顺利！

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数往者顺，知来者逆！
2楼2019-04-02 00:12:07
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匿名

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3楼2019-04-02 10:28:36
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匿名

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4楼2019-04-02 10:41:01
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lizimu566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by 黄黄的黄 at 2019-04-02 10:41:01
ncbi里搜索是通过什么信息来搜呢？引物序列？还是测序结果？
...

测序结果直接blast就可以
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5楼2019-04-02 16:58:32
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盐水花生酱

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 守望者047 at 2019-04-02 00:12:07
去NCBI数据库里调出你的目的序列存成txt或者FASTA，找一个你用的惯的比对软件，推荐DNAMAN,VectorNTI或者clustalx，导入你的目的序列和测序结果里面.seq后缀的那个文件进行比对，保存比对结果。如果不知道你p出的是 ...

大神，如果我有一株新晒出来的真菌，它能产生我想要的物质，我接下来应该怎么分析呢？我的实验方案是这样的我想找到调控产生该物质的目的基因，然后把它搞下来转到别的菌上让它专门产这个物质，这个可行嘛？我现在不知道调控基因是什么应该怎么查呢

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6楼2019-09-06 10:54:09
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