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kfwxz2007

木虫 (正式写手)

[交流] TOPOS分析sra构型的配合物

有一配合物其Cif(文献已报道其为sra拓扑结构),现在有一个自己的配合物,在diamond中简化后可以很清楚的看出也为sra拓扑结构的,自己在TOPOS中试过了,但导出来的不对,可能简化过程不对,请教高手,在TOPOS中怎么样简化处理会可导出相关数据。谢谢~

cif不知道怎么附不上了,网址为http://pubs.acs.org/doi/suppl/10.1021/cg0608615

[ Last edited by kfwxz2007 on 2009-5-14 at 11:33 ]
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kfwxz2007

木虫 (正式写手)

附一相似文献已报道的cif

附一相似文献已报道的cif,
附件怎么传不上去呀?

[ Last edited by kfwxz2007 on 2009-5-14 at 11:15 ]
2楼2009-05-14 11:08:34
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kfwxz2007

木虫 (正式写手)

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3楼2009-05-14 11:17:01
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kfwxz2007

木虫 (正式写手)

成键~

在TOPOS中,可以把原本不连接的原子通过某个操作连接起来么?想尝试下按diamond那样来简化网络~看看这样简化之后用TOPOS能还导出相关数据~
4楼2009-05-14 16:50:47
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jingxuemin

银虫 (小有名气)

这个问题我遇到过

★ ★ ★
kfwxz2007(金币+2,VIP+0):谢谢~~不过在Diamond中处理过后,导出的cif再导入到TOPOS中,貌似出现的图是没变化的呀,我之前试过的~可以告我你的QQ号么?想再请教请教你~谢谢~ 5-15 16:20
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 5-15 21:58
你可以在diamond里,在不同结点间加原子,导出cif文件,然后在TOPOS里,右键把单胞a,b,c值按相同比例减小,直到所有原子连接起来(这样可能由于键长改变,会出现你不想看到的原子之间连接,你可以选择删除,得到你的sra结构),然后就可以计算得到你要的topo数据了
5楼2009-05-15 16:06:31
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kfwxz2007

木虫 (正式写手)

怎么选择性删除的?

用楼上的教的方法处理后,所有的原子连接起来了,不过选择删除时,偶又遇到了一个问题,你是通过什么操作选择删除的?我是想通过Adjacent Matrix删除的,但将所以原子连接后的分子式,双击之后出现的对话框中没有该项,运行Auto CN后,原本想让其相连的原子间的连接又不见了,这怎么处理啊?
谢谢~~
6楼2009-05-17 09:20:23
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fengqian2004

木虫 (著名写手)

★ ★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 5-18 12:10
kfwxz2007(金币+1,VIP+0):跟5楼说的差不多呀,能说一下详细点的在TOPOS里的操作么? 5-18 14:31
在diamond里,通过connect 设置不同的键长, 在不同结点间加原子,导出cif文件,z在在TOPOS里操作
痛并快乐着
7楼2009-05-17 21:44:40
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