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xmen85

铜虫 (小有名气)

[交流] 怎样设计引物和探针

给位前辈,俺老师给了个分子生物学方向的课题,而本人对这方面的知识几乎空白。实验要用到探针和引物,自己看了些资料,可整理不出个头绪。希望各位能不吝下教。万分感谢。。。

[ Last edited by amisking on 2009-7-15 at 08:06 ]
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bbyu007

木虫 (正式写手)


xmen85(金币+1,VIP+0): 5-13 10:53
探针没用过,引物太常用了,都不知道怎么说了,引物不就是短的核苷酸序列么,和你要扩增的目的片段互补即可。。。还是不知道怎么说,你再看看资料吧,或者让做过的师兄师姐带带你,1天就会了
我是笨笨鱼~~~
2楼2009-05-13 10:38:51
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xmen85

铜虫 (小有名气)

还没有师兄师姐做这个方向的。我是第一个,所以不知道怎么下手。不过还是多谢回答。。。
3楼2009-05-13 10:53:01
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love_st

金虫 (著名写手)



xmen85(金币+1,VIP+0): 5-14 08:13
相关的资料还是很多的,看看关于荧光定量PCR方面的资料,应该对你有很大的帮助
4楼2009-05-13 13:29:08
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jiaminl

铁杆木虫 (知名作家)


xmen85(金币+1,VIP+0):不是做核酸杂交,是做RT PCR 6-4 11:48
应该说的详细一点 你是不是要用探针引物去做核酸杂交啊??
Nevergiveup!
5楼2009-05-13 15:16:08
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cauzhangtao

木虫 (正式写手)

primer 3设计
6楼2009-05-13 15:21:00
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liying6929

金虫 (正式写手)

★ ★
xmen85(金币+2,VIP+0): 6-4 11:47
引物的合成,查好cDNA序列,贴到primer5中,就设计出来了,至于探针,你把片段连到sp6或t7启动子的载体上,然后利用探针标记试剂盒,主要是利用里面的带标记的dNTP。反转一下就合成RNA探针了,至于DNA探针应该和这也差不多吧
7楼2009-06-03 12:52:20
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houjinglhy

荣誉版主 (文坛精英)

表达自由,人权之基。

优秀版主

★ ★
xmen85(金币+2,VIP+0): 6-4 11:47
用primer5 或 oligo设计 下载个使用教程看看 很好设计的
从小就学习鲁迅,直到现在才体会到他当时是多么的绝望和无助,却仍要用尽最后一丝力气声嘶力竭的呐喊!
8楼2009-06-03 13:01:33
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love_st

金虫 (著名写手)



xmen85(金币+1,VIP+0): 6-4 11:47
引物设计还是比较简单,看你模板的复杂程度吧,至于探针则也要看你的模板是DNA还是RNA的,不过大体原理都差不多,多看些资料就会更加明白了
9楼2009-06-03 13:40:58
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xmen85

铜虫 (小有名气)

昨晚刚向一个博士师姐请教了,手动设计的效果比软件设计的要好。还可以自己控制片段的长度。只要遵循引物设计的要求就行。
10楼2009-07-03 09:42:15
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