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cassie0795

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS里面discover 和forcite里面的动力学有什么区别吗?或者哪儿擅长哪一方面

MS里面discover   和forcite里面的动力学有什么区别吗?或者哪儿擅长哪一方面

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-17 at 14:18 ]
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cassie0795

金虫 (小有名气)

那么一般的扩散首先要做的是用什么系综呢?
3楼2009-05-13 18:05:04
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guosy1999

木虫 (正式写手)

中纪委反2协会督导员

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-13 17:08
discover里的分子动力学更强大,哈哈。我也要用到discover做动力学扩散,但是现在还么有开始。。。期待高人指点呵呵
少年不识愁滋味,为赋新词强说愁。
2楼2009-05-13 11:23:58
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 5-14 20:35
discover ,forcite 以及其他很多MD软件的原理都是相同的,并且大都可以使用多种力场。
不同的是具体的实现方式和性能。
当年我用forcite的时候还不支持并行,discover是可以的。这是forcite 最致命的地方,不知道现在怎样了。
forcite 有一些discover没有的功能比如退火,的输出结果比disorder 丰富得多。
如果你的体系不大机器够好,可以用F,否则还是用D吧。毕竟动力学的计算量很大很大很大

扩散应该用NVT,更好的是NμT,但不好实现。
5楼2009-05-13 20:26:45
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guosy1999

木虫 (正式写手)

中纪委反2协会督导员

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-15 14:52
回答楼上

forite里面还是不能并行。。

我看到人家计算动力学都是用的discover。呵呵
少年不识愁滋味,为赋新词强说愁。
6楼2009-05-15 13:26:53
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