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濯蝶雨

新虫 (正式写手)

[求助] 分子克隆

最近一直在做分子克隆,线性化载体连接转化,根据neb推荐的各种摩尔比做的连接体系,单菌落是长出来了,可是酶切验证一直是自连,用的是psuper载体,一个月了还没有构建出来,求各位大神指教

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多细胞11

新虫 (正式写手)

★ ★ ★
snoopytbw: 金币+3, 鼓励 2019-03-01 10:52:56
首先确保酶切位点对,并且空载体酶切位点未突变(可以空载体测序验证,当然即使测序对了也不一定能用,有可能酶切位点被甲基化等表观遗传学修饰,导致切不开),适当降低载体浓度,确保大多数载体都能以双酶切的形式切开,并适当延长酶切时间。具体的可以参考文献Why Johnny can't clone: Common pitfalls and not so common solutions.当然可能看了逐步验证还是连不上,挑不到正确的克隆。推荐个人常用方法直接根据载体双酶切位点设计两个引物,直接P质粒,然后双酶加Dpn1三酶酶切,目的片段双酶切,然后按1:3-10酶连即可。载体模板至少要单酶切(防止P出来的载体还是环状的,比如我用的Phusion酶,如果不切就是)

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2楼2019-03-01 09:57:58
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多细胞11

新虫 (正式写手)

酶切保护碱基建议设计长一点6-8bp吧

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3楼2019-03-01 09:59:34
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濯蝶雨

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 多细胞11 at 2019-03-01 09:57:58
首先确保酶切位点对,并且空载体酶切位点未突变(可以空载体测序验证,当然即使测序对了也不一定能用,有可能酶切位点被甲基化等表观遗传学修饰,导致切不开),适当降低载体浓度,确保大多数载体都能以双酶切的形式切 ...

嗯嗯,谢谢指教啦

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4楼2019-03-01 22:39:53
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