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luckied

金虫 (正式写手)

[交流] lammps运行出错:bond atoms missing 已有3人参与

用ms构建si和水结构,在生成data文件,但是运行lammps总是出现:bond atoms 1059 1065 missing on proc 0 at step 51 (../ntopo_bond_partial.cpp:64)的错误…实在摸不着头脑,请各位大神指点一下谢谢各位!

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1378625

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by B202176024 at 2022-03-02 20:06:13
怎么检查初始构型,怎么检查是否有原子重叠...

请问您怎么解决这个问题的呀
4楼2022-05-05 13:52:33
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oxox6085

专家顾问 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
应该是有原子重叠或者挨得太近,仔细检查初始构型
有些事情可能只有计算机模拟能告诉我们答案
2楼2019-02-28 02:25:30
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B202176024

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by oxox6085 at 2019-02-28 02:25:30
应该是有原子重叠或者挨得太近,仔细检查初始构型

怎么检查初始构型,怎么检查是否有原子重叠
3楼2022-03-02 20:06:13
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