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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps运行出错：bond atoms missing
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luckied

金虫 (正式写手)

[交流] lammps运行出错：bond atoms missing 已有3人参与

用ms构建si和水结构，在生成data文件，但是运行lammps总是出现：bond atoms 1059 1065 missing on proc 0 at step 51 (../ntopo_bond_partial.cpp:64)的错误…实在摸不着头脑，请各位大神指点一下谢谢各位！

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1楼 2019-02-27 21:35:27
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oxox6085

专家顾问 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
应该是有原子重叠或者挨得太近，仔细检查初始构型
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有些事情可能只有计算机模拟能告诉我们答案
2楼2019-02-28 02:25:30
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B202176024

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by oxox6085 at 2019-02-28 02:25:30
应该是有原子重叠或者挨得太近，仔细检查初始构型

怎么检查初始构型，怎么检查是否有原子重叠
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3楼2022-03-02 20:06:13
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1378625

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by B202176024 at 2022-03-02 20:06:13
怎么检查初始构型，怎么检查是否有原子重叠...

请问您怎么解决这个问题的呀
赞一下 回复此楼
4楼2022-05-05 13:52:33
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