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ETY

新虫 (小有名气)

[交流] NCBI上怎么找到相似度很低的序列

我每次blast出来 相似度最低99%以上,怎么可以找到60%的呀 求各位大神,帮帮忙

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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
为什么你要相似度很低的

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奋斗是我们前进的动力!
2楼2019-02-27 22:19:29
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ETY

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xn8008 at 2019-02-27 22:19:29
为什么你要相似度很低的

我其实想找相似度94%以上的 但是BLAST出来都是99%以上的,结果发育树图bootstrap值很低,就是想提高这个值

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3楼2019-02-28 15:09:39
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小冀-: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-03-01 13:17:24
引用回帖:
3楼: Originally posted by ETY at 2019-02-28 15:09:39
我其实想找相似度94%以上的 但是BLAST出来都是99%以上的,结果发育树图bootstrap值很低,就是想提高这个值
...

那说明你找的这个family保守性很高

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4楼2019-02-28 15:40:16
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel

引用回帖:
3楼: Originally posted by ETY at 2019-02-28 15:09:39
我其实想找相似度94%以上的 但是BLAST出来都是99%以上的,结果发育树图bootstrap值很低,就是想提高这个值
...

那说明你找的这个family保守性很高

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奋斗是我们前进的动力!
5楼2019-02-28 15:40:19
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ETY

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xn8008 at 2019-02-28 15:40:16
那说明你找的这个family保守性很高
...

是的,这样的花,建树bootstrap值很低,不知道怎么办

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6楼2019-02-28 21:31:32
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by ETY at 2019-02-28 21:31:32
是的,这样的花,建树bootstrap值很低,不知道怎么办
...

你做的是strain还是sub-strain

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7楼2019-02-28 22:19:12
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ETY

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xn8008 at 2019-02-28 22:19:12
你做的是strain还是sub-strain
...

strain

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8楼2019-03-01 11:16:27
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by ETY at 2019-03-01 11:16:27
strain
...

那我考虑你这个蛋白的保守型太高了,即便在genera,甚至family也不会有太多差异
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9楼2019-03-01 21:18:23
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ETY

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xn8008 at 2019-03-01 21:18:23
那我考虑你这个蛋白的保守型太高了,即便在genera,甚至family也不会有太多差异...

好滴,谢谢了

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10楼2019-03-06 09:18:07
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