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xysxys

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[求助] 分子模拟求助已有1人参与

求助，分子动力学模拟构建了几种物质的混合物，如何在动力学分析时分别选定某一种物质？

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1楼 2019-02-27 15:54:15

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pl912

禁虫 (小有名气)

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8楼2020-01-03 15:51:36

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jiaoyixiong

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

1、如果你用lammps和gromacs做的模拟，你可以把不同物质设置成不同的group，分析的时候把对应的group挑出来就行了。
2、如果你用NAMD做模拟，你可以直接根据不同物质的 resname , segname等方式就可以选择出来。

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2楼2019-02-27 16:18:13

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xysxys

金虫 (著名写手)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2019-02-27 16:18:13
1、如果你用lammps和gromacs做的模拟，你可以把不同物质设置成不同的group，分析的时候把对应的group挑出来就行了。
2、如果你用NAMD做模拟，你可以直接根据不同物质的 resname , segname等方式就可以选择出来。

我用的是MS，敬请指教

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3楼2019-02-27 16:31:01

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