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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 分子模拟求助
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xysxys

金虫 (著名写手)

[求助] 分子模拟求助 已有1人参与

求助，分子动力学模拟构建了几种物质的混合物，如何在动力学分析时分别选定某一种物质？
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1楼 2019-02-27 15:54:15
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S-Loser

新虫 (正式写手)
楼主，解决了吗，我也遇到了这样的问题

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4楼2019-06-13 14:51:17
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1、如果你用lammps和gromacs做的模拟，你可以把不同物质设置成不同的group，分析的时候把对应的group挑出来就行了。
2、如果你用NAMD做模拟，你可以直接根据不同物质的 resname  ,  segname等方式就可以选择出来。
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2楼2019-02-27 16:18:13
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xysxys

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2019-02-27 16:18:13
1、如果你用lammps和gromacs做的模拟，你可以把不同物质设置成不同的group，分析的时候把对应的group挑出来就行了。
2、如果你用NAMD做模拟，你可以直接根据不同物质的 resname  ,  segname等方式就可以选择出来。

我用的是MS，敬请指教
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3楼2019-02-27 16:31:01
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nibhao

新虫 (著名写手)
可以用ms对他们分组

发自小木虫Android客户端
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越努力越幸运
5楼2019-12-30 23:26:07
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