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xysxys

金虫 (著名写手)

[求助] 分子模拟求助 已有1人参与

求助,分子动力学模拟构建了几种物质的混合物,如何在动力学分析时分别选定某一种物质?
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pl983

禁虫 (小有名气)

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7楼2020-01-02 14:14:31
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1、如果你用lammps和gromacs做的模拟,你可以把不同物质设置成不同的group,分析的时候把对应的group挑出来就行了。
2、如果你用NAMD做模拟,你可以直接根据不同物质的 resname  ,  segname等方式就可以选择出来。
2楼2019-02-27 16:18:13
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xysxys

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2019-02-27 16:18:13
1、如果你用lammps和gromacs做的模拟,你可以把不同物质设置成不同的group,分析的时候把对应的group挑出来就行了。
2、如果你用NAMD做模拟,你可以直接根据不同物质的 resname  ,  segname等方式就可以选择出来。

我用的是MS,敬请指教
3楼2019-02-27 16:31:01
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S-Loser

新虫 (正式写手)

楼主,解决了吗,我也遇到了这样的问题

发自小木虫Android客户端
4楼2019-06-13 14:51:17
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