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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zcy800204

金虫 (正式写手)

[交流] 帮忙解决一下下列错误

Alert level B
PLAT242_ALERT_2_B Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for        C20     
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H1B    ..  H2A     ..       1.85 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H1B    ..  H2A     ..       1.85 Ang.
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O2     -   H2A    ...          ?      
--------------------------------------------------------------------------------Alert level C
STRVA01_ALERT_4_C           Flack test results are meaningless.
           From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack    0.000
           From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su   10.000
PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       3.24 Ratio
PLAT222_ALERT_3_C Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       3.62 Ratio
PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds (x 1000) Ang ...          5      
PLAT032_ALERT_4_C Std. Uncertainty in Flack Parameter too High ...      10.00      
PLAT790_ALERT_4_C Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #          3      
              H2 O
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xglegl

木虫 (正式写手)

★ ★
zcy800204(金币+1,VIP+0): 5-9 09:15
zcy800204(金币+1,VIP+0): 5-9 10:50
C20原子指认错误,H1B的方向错误 删除重新加  H2A没有受体 重新加 C级错误就没有必要改了
2楼2009-05-09 09:05:54
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
zcy800204(金币+1,VIP+0): 5-9 11:51
zcy800204(金币+1,VIP+0): 5-9 11:52
zcy800204(金币+1,VIP+0): 5-16 09:02
H2A 加得不好的可能性更大. 建议删掉重新加

有个水离主体太远, 建议平移一下,是其靠近主体.

另外, 是否没有重的原子? 则绝对构型无法确定, 建议把Friedal对 merg掉.
xi2004-emuch@163.com
3楼2009-05-09 11:03:41
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