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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】分子高温分解的动力学模拟
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

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[交流] 【求助】分子高温分解的动力学模拟

最近一朋友做了一实验，10来个原子的体系在某个温度下分解。现在不能确定具体产物。想借助分子动力学模拟预测下产物。
有熟悉此类计算的朋友，请指教下

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-18 at 13:12 ]
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1楼 2009-05-07 14:51:15
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
csfn(金币+1,VIP+0):3q 5-8 10:14
csfn(金币+1):3q
什么体系啊？根据我的经验，用MD可能不是好办法。不过我没有具体搞过这方面。
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2楼2009-05-07 15:31:29
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recoli

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论 5-7 19:48
csfn(金币+1,VIP+0):确实需要再讨论下 5-8 10:14
csfn(金币+1):3q
一般的分子动力学技术无法模拟化学反应。

产物都不清楚，真的很难计算，正常的方法都不能做到。

为什么不去做个测试，现在分析技术这么多，核磁质谱红外紫外等等等等。。。
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3楼2009-05-07 16:04:36
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论 5-7 19:48
csfn(金币+1,VIP+0):呵呵 5-8 10:15
csfn(金币+1):3q
分子动力学是计算大体系（1万-100万原子）的方法，对这个可能不适用。
在复旦编的物理化学实验上听说过有个叫分子反应动力学（or 动态学，计不清楚了）的，可能有用。
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4楼2009-05-07 16:12:39
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superdirac

木虫 (正式写手)
★ ★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论 5-7 19:49
csfn(金币+1,VIP+0):这是一个离子液体方面的问题 金属团簇我也只做过1年不到赫赫 5-8 10:16
10来个原子的体系在某个温度下分解
  
  我看你是做金属团簇的！  用cpmd, vasp，aimd 计算一下反应的动力学过程，然后再去 那  高斯  算过渡态的精确结构。
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我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋
5楼2009-05-07 18:16:01
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长
cpmd 不知是否合适
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6楼2009-05-07 18:30:14
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huangshp

金虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 5-8 12:33
csfn(金币+1,VIP+0):thanks 5-10 08:51
很难吧，首先原子数少，用分子动力学不太合适，另外，分子动力学挺耗时
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7楼2009-05-08 11:02:28
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jjf_sxnu

铜虫 (正式写手)
★ ★
csfn(金币+1,VIP+0):thank you 5-10 08:50
csfn(金币+1):3q
楼主，我看到过有人做过，是可以的，可是我也不知道怎么做的。我也想用CPMD来做这个，可请教了很多人，都不清楚。
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8楼2009-05-08 13:03:22
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长
只要能大概模拟 大家有什么方法推荐也行
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9楼2009-05-10 08:51:28
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