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iamllo

新虫 (小有名气)

[求助] 基因序列已有1人参与

求助大神:请问如果我知道了某种菌的致病基因 想看看自己已经测序的菌株中是否含有这些致病基因 并找到保守序列和特异序列 是不是首先要做的就是根据这种菌的致病基因 在ncbi上找到这些致病基因的序列 然后对这些序列建库 与自己已测序菌进行比对 根据比对结果 截取出比对上的序列然后进行blast比对?

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iamllo

新虫 (小有名气)

比对上了是说明该菌株含有这个致病基因还是说明这段序列是保守序列?

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3楼2019-02-13 22:27:29
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彼岸的草

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-02-13 20:29:10
用测序的菌株的序列与你下载的序列直接比对就可以了
2楼2019-02-13 08:53:36
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iamllo

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 彼岸的草 at 2019-02-13 08:53:36
用测序的菌株的序列与你下载的序列直接比对就可以了

谢谢 请问如果比对上了是说明该菌株含有这个致病基因还是说明该段序列是保守序列?

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4楼2019-02-13 22:28:48
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