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木虫 (著名写手)

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[求助] 得到的DNA测序结果有一个碱基有错应该怎样分析已有3人参与

上课时，老师出了个题，一个DNA测序文件，在第77位机器测定为C，但是下面的峰可以认为是G，根据学到的一点皮毛，我把C碱基翻译成蛋白质，把G碱基的翻译成蛋白质，用DNAstar软件分析序列，发现这一个碱基变化，导致翻译成两个氨基酸残基，一个组氨酸一个苏氨酸好像（记不清了），我的后面的想法是，把这两个碱基有变化的肽链看一看改变的氨基酸位置是在可变域还是固定域，用NCBI的BLAST数据库找不同种的生物的同源蛋白，再分析这个单碱基造成的氨基酸改变是不是致死突变，其他生物的类似蛋白在这个位置有没有突变。
我能想到的就是这些，我想问问各位大佬，你们遇到这种情况，是让公司重测，还是自己分析这个突变要不要紧，还有分析思考的流程，谢谢。

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1楼2019-02-06 22:58:31

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引用回帖:

4楼: Originally posted by 十点零 at 2019-02-09 04:41:25
这个需要看测序的峰图，一般来说，前后一百bp左右的测序结果不是特别准确的，而且出现一个bp的碱基不同也是很正常的，同一物种之间也有很多差异位点，可以重新做一个克隆来看，也可以保留现在的结果直接用
...

我们的思考题就是怎样确定这一个碱基的差异，不会影响后续的实验和结果。老师让自己想