【求助】amber轨迹分析中如何测量两个平面夹角 - 分子模拟 - DS/Sybyl/Autodock

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禁虫 (小有名气)

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1楼 2009-05-05 19:17:40

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捐助贵宾 (正式写手)

二当家的

★ ★
loovfnd(金币+2,VIP+0):简练的回答！ 5-5 22:25

把轨迹导入VMD
用tcl语言定义平面法向量
算法向量的夹角

下苦功，三个字，一个叫下，一个叫苦，一个叫功，一定要振作精神，下苦功。

2楼2009-05-05 20:39:24

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木虫 (著名写手)

★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 5-6 08:47

楼上正解。不过苯环结构不一定绝对共面，一般的方法是用最小二乘法确定最小二乘平面。

[ Last edited by neweroica on 2009-5-6 at 00:28 ]

Simpler, stronger, more tolerant

3楼2009-05-06 00:27:35

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