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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » pymol如何显示双键
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yushihua

新虫 (小有名气)

[交流] pymol如何显示双键 已有1人参与

求助一个问题:用pymol如何显示分子对接后底物分子里的碳碳双键?我用了命令符set valence, 0.1会显示氨基酸残基里的双键，但不会显示底物分子里面的双键。求解答下，谢谢了。

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1楼 2019-01-15 21:51:06
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yushihua

新虫 (小有名气)
用DS打开是可以自动显示氢键的，但是在pymol中就不行了

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2楼2019-01-15 23:22:04
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张晓铮

木虫 (小有名气)
同问
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加油哦！！！
3楼2020-07-22 17:10:57
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张晓铮

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
找到一个笨办法，在编辑模式下，删除底物原有单键，新建双键（前提是指导哪里是双键）
# In editing mode: select the bond using Ctrl-right-click, then enter:
unbond pk1,pk2
bond pk1,pk2,4
# 1: single bond, 2: double bond, 3:triple bond, 4:delocalized
赞一下(2人) 回复此楼
加油哦！！！
4楼2020-07-22 17:38:34
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