24小时热门版块排行榜    

查看: 3468  |  回复: 9

18731094454

铜虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算 已有1人参与

新手求教!
    因实验需要,刚刚学习高斯计算。在高斯计算弱相互作用时,要考虑色散作用,请问在编写任务时,要把色散校正加到几何优化中,还是最后能量计算中?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小红豆: 金币+5, 感谢交流 2019-01-12 17:23:38
高斯计算时,只要选择了考虑色散作用(电子相关)的具体方法,如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等,就自然会考虑色散作用,无需另外指定。
2楼2019-01-11 17:44:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-11 17:44:19
高斯计算时,只要选择了考虑色散作用(电子相关)的具体方法,如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等,就自然会考虑色散作用,无需另外指定。

多谢指点,十分感谢!

发自小木虫Android客户端
3楼2019-01-11 21:52:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 18731094454 at 2019-01-11 21:52:10
多谢指点,十分感谢!
...

另外,还有个问题,不太清楚,就是画分子堆积的模型有什么依据,间距什么的有什么要求吗?不知您是否清楚,若有研究,还望不吝赐教

发自小木虫Android客户端
4楼2019-01-11 22:00:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-11 17:44:19
高斯计算时,只要选择了考虑色散作用(电子相关)的具体方法,如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等,就自然会考虑色散作用,无需另外指定。

另外,还有个问题,不太清楚,就是画分子堆积的模型有什么依据,间距什么的有什么要求吗?不知您是否清楚,若有研究,还望不吝赐教

发自小木虫Android客户端
5楼2019-01-11 22:02:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

分子堆积,看之间是否能够形成氢键,有可能,则按氢键考虑安排距离。如果纯粹是范德华作用,则按范德华距离安排分子,尽可能多地安排范德华作用的作用点。然后进行优化、计算,得到范德华的分子堆积情形和计算结果。
6楼2019-01-12 09:01:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 09:01:02
分子堆积,看之间是否能够形成氢键,有可能,则按氢键考虑安排距离。如果纯粹是范德华作用,则按范德华距离安排分子,尽可能多地安排范德华作用的作用点。然后进行优化、计算,得到范德华的分子堆积情形和计算结果。

那请问氢键距离大致在什么范围,范德华作用又是什么范围?再者例如是两个苯堆积的话,这是直接面面堆积,还是说有一定错位?初次接触,问题有点多,还请见谅,再次感谢
7楼2019-01-12 10:32:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

氢键通式X-H...Y,H...Y约取2Å。两个苯堆积,面对面对叠,距离是C的范德华半径的加和,距离的数量级约为3Å。两个苯堆积,我还写过帖子和文章。
8楼2019-01-12 10:47:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 10:47:45
氢键通式X-H...Y,H...Y约取2Å。两个苯堆积,面对面对叠,距离是C的范德华半径的加和,距离的数量级约为3Å。两个苯堆积,我还写过帖子和文章。

好的,十分感谢!
9楼2019-01-12 14:42:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 10:47:45
氢键通式X-H...Y,H...Y约取2Å。两个苯堆积,面对面对叠,距离是C的范德华半径的加和,距离的数量级约为3Å。两个苯堆积,我还写过帖子和文章。

您好,前不久根据您说的,进行模拟计算,优化后分子变形,想必是分子间结构画得不太对。有一个想法是,对于分子具体是怎样堆积的,是不是需要在CCDC中得到它的分子间距离或是怎样的堆积方式(是面面重叠还是错位重叠),根据这些数据,才能进一步画好分子堆积的输入文件,然后再进行后续的调整优化分子堆积
10楼2019-01-21 15:11:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 18731094454 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研一志愿长安大学材料与化工309分请求调剂 +6 dtdxzxx 2026-03-06 8/400 2026-03-10 08:31 by Linda Hu
[考研] 0703求调剂 +10 c297914 2026-03-06 11/550 2026-03-09 18:37 by 30660438
[考研] 297求调剂 +3 胡达灵 2026-03-05 5/250 2026-03-08 23:13 by 清风月
[考研] 医学检验专业26考研求调剂 +3 琪ya 2026-03-03 5/250 2026-03-08 22:56 by 清风月
[考博] 26年博士申请 +4 科研狗111 2026-03-07 4/200 2026-03-08 21:56 by 0611517sll
[考研] 301求调剂 +11 朝天椒的双马尾 2026-03-05 11/550 2026-03-08 21:50 by 知足常乐的乐
[考研] 材料调剂 +7 ounce. 2026-03-05 15/750 2026-03-08 09:39 by wangjihu
[考研] 0703化学调剂 +5 G212 2026-03-03 6/300 2026-03-07 21:30 by yinhuanshun
[考研] 求调剂,不管什么专业,我是可塑造的人才一枚,希望遇到知己老师捞捞我 +4 13102137290 2026-03-06 5/250 2026-03-07 21:21 by lissomchan
[考研] 一志愿中国石油大学(华东) 本科齐鲁工业大学 求调剂 +3 snw石 2026-03-07 3/150 2026-03-07 20:01 by houyaoxu
[考研] 304求调剂 +4 52hz~~ 2026-03-05 5/250 2026-03-07 15:47 by lature00
[考研] 268求调剂 +4 刘合华 2026-03-05 4/200 2026-03-06 11:18 by lature00
[考研] 材料与化工354调剂 +4 Lucy-xiao 2026-03-06 7/350 2026-03-06 09:57 by hxuq8429
[考研] 085602 293分求调剂 +3 SivanNano. 2026-03-05 3/150 2026-03-05 19:41 by caszguilin
[考研] 材料085600 303求调剂 +7 1bygone 2026-03-04 7/350 2026-03-05 09:39 by oxidpl
[考研] 267调剂求助 +5 聪少OZ 2026-03-04 5/250 2026-03-05 09:38 by kakakapanpan
[考研] 286 +6 ksncj 2026-03-04 6/300 2026-03-04 20:49 by lature00
[考研] 0703化学求调剂 +3 将未有期 2026-03-04 3/150 2026-03-04 16:19 by sslc1985
[考研] 295求调剂 +6 等春来, 2026-03-04 6/300 2026-03-04 16:11 by zhukairuo
[考研] 347分电子信息专硕求调剂 +3 咕嘟咕嘟1 2026-03-03 3/150 2026-03-04 12:32 by 热情沙漠
信息提示
请填处理意见