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汕头大学海洋科学接受调剂
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18731094454

铜虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算 已有1人参与

新手求教！
    因实验需要，刚刚学习高斯计算。在高斯计算弱相互作用时，要考虑色散作用，请问在编写任务时，要把色散校正加到几何优化中，还是最后能量计算中？
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1楼 2019-01-11 15:48:46
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小红豆: 金币+5, 感谢交流 2019-01-12 17:23:38
高斯计算时，只要选择了考虑色散作用（电子相关）的具体方法，如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等，就自然会考虑色散作用，无需另外指定。
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2楼2019-01-11 17:44:19
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18731094454

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-11 17:44:19
高斯计算时，只要选择了考虑色散作用（电子相关）的具体方法，如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等，就自然会考虑色散作用，无需另外指定。

多谢指点，十分感谢！

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3楼2019-01-11 21:52:10
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18731094454

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 18731094454 at 2019-01-11 21:52:10
多谢指点，十分感谢！
...

另外，还有个问题，不太清楚，就是画分子堆积的模型有什么依据，间距什么的有什么要求吗？不知您是否清楚，若有研究，还望不吝赐教

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4楼2019-01-11 22:00:04
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18731094454

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-11 17:44:19
高斯计算时，只要选择了考虑色散作用（电子相关）的具体方法，如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等，就自然会考虑色散作用，无需另外指定。

另外，还有个问题，不太清楚，就是画分子堆积的模型有什么依据，间距什么的有什么要求吗？不知您是否清楚，若有研究，还望不吝赐教

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5楼2019-01-11 22:02:03
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

分子堆积，看之间是否能够形成氢键，有可能，则按氢键考虑安排距离。如果纯粹是范德华作用，则按范德华距离安排分子，尽可能多地安排范德华作用的作用点。然后进行优化、计算，得到范德华的分子堆积情形和计算结果。
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6楼2019-01-12 09:01:02
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18731094454

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 09:01:02
分子堆积，看之间是否能够形成氢键，有可能，则按氢键考虑安排距离。如果纯粹是范德华作用，则按范德华距离安排分子，尽可能多地安排范德华作用的作用点。然后进行优化、计算，得到范德华的分子堆积情形和计算结果。

那请问氢键距离大致在什么范围，范德华作用又是什么范围？再者例如是两个苯堆积的话，这是直接面面堆积，还是说有一定错位？初次接触，问题有点多，还请见谅，再次感谢
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7楼2019-01-12 10:32:39
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

氢键通式X-H...Y，H...Y约取2Å。两个苯堆积，面对面对叠，距离是C的范德华半径的加和，距离的数量级约为3Å。两个苯堆积，我还写过帖子和文章。
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8楼2019-01-12 10:47:45
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18731094454

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 10:47:45
氢键通式X-H...Y，H...Y约取2Å。两个苯堆积，面对面对叠，距离是C的范德华半径的加和，距离的数量级约为3Å。两个苯堆积，我还写过帖子和文章。

好的，十分感谢！
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9楼2019-01-12 14:42:18
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18731094454

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 10:47:45
氢键通式X-H...Y，H...Y约取2Å。两个苯堆积，面对面对叠，距离是C的范德华半径的加和，距离的数量级约为3Å。两个苯堆积，我还写过帖子和文章。

您好，前不久根据您说的，进行模拟计算，优化后分子变形，想必是分子间结构画得不太对。有一个想法是，对于分子具体是怎样堆积的，是不是需要在CCDC中得到它的分子间距离或是怎样的堆积方式（是面面重叠还是错位重叠），根据这些数据，才能进一步画好分子堆积的输入文件，然后再进行后续的调整优化分子堆积
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10楼2019-01-21 15:11:44
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