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18731094454

铜虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算 已有1人参与

新手求教!
    因实验需要,刚刚学习高斯计算。在高斯计算弱相互作用时,要考虑色散作用,请问在编写任务时,要把色散校正加到几何优化中,还是最后能量计算中?
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小红豆: 金币+5, 感谢交流 2019-01-12 17:23:38
高斯计算时,只要选择了考虑色散作用(电子相关)的具体方法,如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等,就自然会考虑色散作用,无需另外指定。
2楼2019-01-11 17:44:19
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18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-11 17:44:19
高斯计算时,只要选择了考虑色散作用(电子相关)的具体方法,如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等,就自然会考虑色散作用,无需另外指定。

多谢指点,十分感谢!

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3楼2019-01-11 21:52:10
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18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 18731094454 at 2019-01-11 21:52:10
多谢指点,十分感谢!
...

另外,还有个问题,不太清楚,就是画分子堆积的模型有什么依据,间距什么的有什么要求吗?不知您是否清楚,若有研究,还望不吝赐教

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4楼2019-01-11 22:00:04
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18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-11 17:44:19
高斯计算时,只要选择了考虑色散作用(电子相关)的具体方法,如MP2、MP4、CCSD、DFT-3等,就自然会考虑色散作用,无需另外指定。

另外,还有个问题,不太清楚,就是画分子堆积的模型有什么依据,间距什么的有什么要求吗?不知您是否清楚,若有研究,还望不吝赐教

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5楼2019-01-11 22:02:03
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

分子堆积,看之间是否能够形成氢键,有可能,则按氢键考虑安排距离。如果纯粹是范德华作用,则按范德华距离安排分子,尽可能多地安排范德华作用的作用点。然后进行优化、计算,得到范德华的分子堆积情形和计算结果。
6楼2019-01-12 09:01:02
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18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 09:01:02
分子堆积,看之间是否能够形成氢键,有可能,则按氢键考虑安排距离。如果纯粹是范德华作用,则按范德华距离安排分子,尽可能多地安排范德华作用的作用点。然后进行优化、计算,得到范德华的分子堆积情形和计算结果。

那请问氢键距离大致在什么范围,范德华作用又是什么范围?再者例如是两个苯堆积的话,这是直接面面堆积,还是说有一定错位?初次接触,问题有点多,还请见谅,再次感谢
7楼2019-01-12 10:32:39
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

氢键通式X-H...Y,H...Y约取2Å。两个苯堆积,面对面对叠,距离是C的范德华半径的加和,距离的数量级约为3Å。两个苯堆积,我还写过帖子和文章。
8楼2019-01-12 10:47:45
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18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 10:47:45
氢键通式X-H...Y,H...Y约取2Å。两个苯堆积,面对面对叠,距离是C的范德华半径的加和,距离的数量级约为3Å。两个苯堆积,我还写过帖子和文章。

好的,十分感谢!
9楼2019-01-12 14:42:18
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18731094454

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2019-01-12 10:47:45
氢键通式X-H...Y,H...Y约取2Å。两个苯堆积,面对面对叠,距离是C的范德华半径的加和,距离的数量级约为3Å。两个苯堆积,我还写过帖子和文章。

您好,前不久根据您说的,进行模拟计算,优化后分子变形,想必是分子间结构画得不太对。有一个想法是,对于分子具体是怎样堆积的,是不是需要在CCDC中得到它的分子间距离或是怎样的堆积方式(是面面重叠还是错位重叠),根据这些数据,才能进一步画好分子堆积的输入文件,然后再进行后续的调整优化分子堆积
10楼2019-01-21 15:11:44
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