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[资源] 【转帖】网上看到,关于优化时对称性

关于对称性
1。gaussian中输入什么对称性,一般优化的结果仍然还是那个对称性,比如CO2,如果初始两个CO键长输入不是完全相等(比如一个1.214,一个1.215),那么程序就会判断为C∞v 对称,那么优化结果虽然键长几乎相等,但仍然认为是C∞v ,这个从振动频率或者分子轨道对称性上可以看出来。--我们知道,CO2实际上是直线的两边对称的构型,其对称性应该是D∞v 。因此,为了得到高的对称性,必须输入的时候,精确地输入数值,比如sqrt(2),就要保留很多的小数点,180.0角,就不能写成179.9。

2。有时计算过程中对称性会变化,比如做过渡态的时候,这时需要用 IOP(2/16=3),否则计算会出错退出。

3。比如用直角坐标输入一个正三角形构型,其对称性应该是D3h,但是如果输入的小数点后面的数字不够多,那么常常得到的是C2v或其它。为了消除输入文件中坐标的有效位数的影响,得到较高的对称性,可以降低对称性判断的严格性。一般可以用symm=loose,这等价于 IOP (2/17=4, 2/18=3)。还可以减小这4和3这两个数值,使得更加loose,但不能过小,否则会出错。symm=loose只是在第一步判断输入构型的对称性时用到。
此外,也可以用gaussview来调整设置初始构型的对称性。

4。如果要降低对称性,那么可以用symm(PG=C3v)等等来做。使判断出来的对称性为C3v的一个子群。即由PG来限制最高对称性。

附用到的IOP的详细解释。

IOp(2/16)
action taken if the point group changes during an optimization. IOP(2/16=0)Abort the job. IOP(2/16=1)Keep going. IOP(2/16=2)Keep going and leave symmetry on, using the old symmetry. IOP(2/16=3)Keep going and leave symmetry on, using the new symmetry

IOp(17)
Tolerance for distance comparisons in symmetry determination.
0   Default (determined in the symmetry package, currently 1.d-8).
N>0   10-N.
N<0 10N, use the same tolerance for orientation.

IOp(18)
Tolerance for non-distance comparisons in symmetry determination.
0   Default (determined in the symmetry package, currently 1.d-7).
N>0   10 -N.
N<0   10 N, use the same tolerance for orientation.

有时候分子对称性太高经常无法优化收敛,这时可以加一个nosymm,有时挺管用的。
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abbott

金虫 (著名写手)


谢谢楼主分享

太好了 收藏
2楼2009-05-04 17:24:10
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