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brianluy

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 10金币求助CIF文件里键长键角排序的问题，谢谢！

热心版友们好：


     今天新手我弄了大半天结构，碰到几个问题，其中一个问题是在CIF文件里加入选择的键长键角，

loop_
_geom_bond_atom_site_label_1
_geom_bond_atom_site_label_2
_geom_bond_distance
_geom_bond_site_symmetry_2
_geom_bond_publ_flag
Cd1 O3 2.262(3) 2_755 ?
Cd1 O4 2.274(3) 1_445 ?
Cd1 O5 2.289(3) . ?
Cd1 O1 2.308(3) . ?
Cd1 O6 2.311(3) . ?
Cd1 O2 2.363(3) 2_655 ?
O2 Cd1 2.363(3) 2_655 ?
O3 Cd1 2.262(3) 2_755 ?
O4 Cd1 2.274(3) 1_665 ?

本来我准备把后面的 ? 改成 yes 的，但无意中发现怎么顺序有点乱，而且发现
Cd1 O3 2.262(3) 2_755 ?
和
O3 Cd1 2.262(3) 2_755 ?
应该是重了，应该删除的，



新手我不知在解析过程中，那里出了问题，或者怎么样可以把这些顺序给排好，几个数据我可以手工弄，但后面还有更多的键角的数据，

请知道的版友帮忙，THX！
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1楼 2009-05-04 16:15:01
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 5-4 19:25
brianluy(金币+5,VIP+0):谢谢参与指点！ 5-4 20:29
如果你的.ins中原子是排好序的, 就不会太乱.
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xi2004-emuch@163.com
2楼2009-05-04 17:51:09
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brianluy

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-5-4 17:51:
如果你的.ins中原子是排好序的, 就不会太乱.

我一直是用Shelxtl里的XSHELL里的 atom  sort命令来排序的，

我还没有在ins里排过，xi2004 兄能指点一下新手，在INS里用什么命令排呀，这和我以前的排序一样吗，谢谢解答！
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3楼2009-05-04 20:31:51
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peterdong

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢,学习了,呵呵 5-4 22:05
brianluy(金币+5,VIP+0):谢谢，我马上试试！看来还是XP最正宗！ 5-4 23:05
在XP下
sort/n
sort $Cd $O
或者
假如含有五种类型原子
可以
sort/n
sort type5 type4 type3 type2 type1
赞一下(11人) 回复此楼
4楼2009-05-04 20:47:14
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brianluy

捐助贵宾 (正式写手)
我试了几次，打开CIF文件发现还是和以前一样

不知大家以前留意过没有，

我个人潜意识里感觉应该
M--O1
M--O2
M--O3
-------

这样的顺序，现在O2跑到O1前，就是不爽，

请大家有空时看看，THX！
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5楼2009-05-05 14:30:23
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qlmeng

银虫 (初入文坛)
我觉得有比较简便的方法，在Tab文件中有键长和键角。你可以试试！
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6楼2009-05-05 15:41:16
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peterdong

至尊木虫 (著名写手)
★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 5-11 09:45
你也可以手动在cif文件中把顺序直接改过来，保存就可以了
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7楼2009-05-05 21:50:52
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rhl

新虫 (初入文坛)
我不知道啊，我也想学习呢
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8楼2009-05-10 17:24:50
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