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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】怎么判断质子转移过程? 另加12金币由版主扣除

诸位,怎么用gaussian计算判断质子转移过程?
在审稿意见中有:
I think the preference of proton transfer only the energy criterion evaluated from the enthalpies is correct.
请问这个通过计算能量角度来验证是质子转移是怎么回事?能够帮忙解释更清楚些?
或者提供经典点的相应的参考文献。
谢谢!

[ Last edited by loovfnd on 2009-5-4 at 22:33 ]
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

★ ★
loovfnd(金币+2,VIP+0):写的挺好的,希望有人给你答案! 5-7 22:12
文献:J. Am. Chem. Soc., 2005, 127 (7), 2324-2333中,结论提到Hydride transfer 和 proton transfer的区别:

Hydride transfer中过渡态可能比他链接的donor和acceptor还稳定些。
理解为在势能面上可能过渡态处于“山谷”中,而proton transfer过程中,过渡态应该处于“山峰”。
请问这个规律有通用性吗?也就是对于其他类型的有机物之间质子转移,可以应用这个结论吗?例如有机碱(活性位为N原子)和醇或者水(夺取羟基上的质子氢)。

还有对于Hydride transfer 和 proton transfer这两个过程对应的过渡态也有区别。在proton transfer的过渡态中,C…H…C 这三个原子基本上成(或者近似于)一条直线,而在Hydride transfer的过渡态中,C…H…C 这三个原子对应的角度是明显小于180度的。
请问这个规律有通用性吗?也就是对于其他类型的有机物之间质子转移,可以应用这个结论吗?例如有机碱(活性位为N原子)和醇或者水(夺取羟基上的质子氢),这样应该是存在三元体:N…H…O

[ Last edited by majun04 on 2009-5-4 at 21:54 ]
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2楼2009-05-04 21:52:50
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

能够根据过渡态所链接的两个物质的电荷分布来判断吗?
例如:A+B-H--->(A-H)+B
A和B都是中性分子,A的电荷接近为零,B电荷也接近为零,而A-H的电荷为0.8,B的电荷为-0.8
能够通过这些电荷数的变化来说明,在这个过程中是质子氢的转移吗?
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3楼2009-05-06 10:45:13
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majun04

木虫 (著名写手)

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★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):呵呵 期待高人 5-9 13:35
诸位,最近查文献发现有的说是质子转移有的说是氢原子转移,说法不统一啊,我无法判断那种说法是正确的。
这个其实是我的文章中一个很次要的地方,并不影响我得结论和分析过程,但必须给审稿人一个回复才行。

我想氢原子是带有电荷得,质子应该不带电荷,这样他们得电子云分布应该不同啊,轨道信息也应该不同啊,请问能够从轨道分析能够判断是质子转移还是氢原子转移吗?具体应该怎么进行轨道分析?还有这样是不是和我在文章中以电荷分布为判据一样没有说服力?
有没有更好的办法?或者提供例子,也好。

非常着急,恳请诸位帮忙啊。

[ Last edited by majun04 on 2009-5-7 at 22:11 ]
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4楼2009-05-07 22:08:13
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