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[求助]
求超算脚本(Orca软件)
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如题,本人想在学校超算用Orca软件计算,需要PBS脚本,无奈没有编程基础,网上下载了一个类似的脚本改了一下,请各位帮我看看哪里有问题?多谢! #PBS -S /bin/bash #PBS -j oe #PBS -l nodes=1:ppn=12 #PBS -q cal-l cat "$PBS_NODEFILE" # go to work dir cd $PBS_O_WORKDIR export orcapath=/opt/software/Orca/orca_4_0_0_linux_x86_64 tdir=/state/partition1/$PBS_O_LOGNAME/$PBS_JOBID mkdir -p $tdir cp ${PBS_O_WORKDIR}/H2O.inp $tdir cd $tdir echo "ORCA job start at" `date` time $orcapath/orca H2O.inp > ${PBS_O_WORKDIR}/H2O.log rm ${tdir}/H2O.inp mv ${tdir}/H2O.* $PBS_O_WORKDIR echo "ORCA job finished at" `date` echo "Work Dir is : $PBS_O_WORKDIR" rm -rf $tdir PS:目录是opt/software/Orca 软件版本是orca_4_0_0_linux_x86_64 |
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