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tnhb

木虫 (正式写手)

[求助] 求超算脚本(Orca软件)

如题,本人想在学校超算用Orca软件计算,需要PBS脚本,无奈没有编程基础,网上下载了一个类似的脚本改了一下,请各位帮我看看哪里有问题?多谢!
#PBS -S /bin/bash
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=1:ppn=12
#PBS -q cal-l

cat "$PBS_NODEFILE"

# go to work dir
cd $PBS_O_WORKDIR

export orcapath=/opt/software/Orca/orca_4_0_0_linux_x86_64

tdir=/state/partition1/$PBS_O_LOGNAME/$PBS_JOBID

mkdir -p $tdir

cp ${PBS_O_WORKDIR}/H2O.inp $tdir

cd $tdir

echo "ORCA job start at" `date`

time $orcapath/orca H2O.inp > ${PBS_O_WORKDIR}/H2O.log

rm ${tdir}/H2O.inp
mv ${tdir}/H2O.* $PBS_O_WORKDIR

echo "ORCA job finished at" `date`

echo "Work Dir is : $PBS_O_WORKDIR"

rm -rf $tdir


PS:目录是opt/software/Orca
软件版本是orca_4_0_0_linux_x86_64
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