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whovering

金虫 (小有名气)

[交流] 【交流/求助】急急!!请教 克隆16SrRNA基因 可以用通用引物吗

有做细菌分类的吗?我想对一未知菌进行分类,拟采用16SrRNA基因序列比对法。我该如何获得该菌的16SrRNA基因呢?有通用引物吗?如果没有我该怎么办呢?谢谢

[ Last edited by amisking on 2009-12-12 at 19:20 ]
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hilaryyyy

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+0,VIP+0):你这种已经构成扣分的条件了,下次注意。 12-12 19:21
!我承认 我错了
我改还不行吗
OMG

[ Last edited by hilaryyyy on 2009-12-17 at 20:50 ]
二十一世纪什么最贵,人才!
2楼2009-12-12 18:51:58
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yinhuali123

银虫 (小有名气)

可以的
3楼2009-12-12 19:19:28
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hongrunge

铁杆木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
27f 1492r就可以,一般的真细菌都可以扩增出
4楼2009-12-13 13:48:26
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spiderboy

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hongrunge at 2009-12-13 13:48:
27f 1492r就可以,一般的真细菌都可以扩增出

同意楼上的。。前两个星期我就做过了,从土壤里提基因组,用27F和1492R来扩16S rDNA,做克隆,测序了一百多个。。。不过基因组放两天就降解了,太夸张了。。。
5楼2009-12-13 14:06:43
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hongrunge

铁杆木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by spiderboy at 2009-12-13 14:06:

同意楼上的。。前两个星期我就做过了,从土壤里提基因组,用27F和1492R来扩16S rDNA,做克隆,测序了一百多个。。。不过基因组放两天就降解了,太夸张了。。。

不会吧
提出的基因组一般溶于TE-70度长期保存。现用的话置于4度冰箱,2天的话一般是没问题的。楼上的降解速率可能是因为提出的总DNA不纯,或者溶剂有污染以及溶剂配制有问题
6楼2009-12-14 01:16:18
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steven689

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
通用引物可以用,但需要注意操作时你的体系不能有任何外来微生物的污染,尤其是水不能被污染,要环境必须复合求,即使在超净台,也会面临死菌的污染,出现假阳性干扰你的待测基因的扩增。所以做的时候要谨慎小心。祝福你了,
7楼2009-12-14 07:08:53
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