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zjy1818

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】gaussian 原子定位问题!!!

gaussian 里是否可以设定一个原子的精确坐标,然后其他原子跟着一块动,而且保持原来构型,我知道鼠标可以,但鼠标无法精确定位,而如果一个个输入原子坐标太麻烦了
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-5 08:29
引用回帖:
Originally posted by zjy1818 at 2009-4-30 17:38:


我知道Gview可以调出坐标,可是它只能改变一个原子位置,其他原子无法同时移动。 比如我有一个已经优化好的分子,然后我要将这个分子移到我要的精确坐标,难道我要一个一个算出来,一个一个原子输入? 我知道 ...

高斯输出文件中的坐标都是以分子的重心为原点的(就是那个standard orientation),因此你要把这个分子移动到某个点上,只需要把这个点的xyz坐标分别加到每个原子的xyz坐标上,这样分子的重心就落到了这个点上,分子结构是保持不变的。加的过程用excel就很容易实现的!

[ Last edited by hairan on 2009-5-4 at 19:12 ]
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
7楼2009-05-03 21:25:03
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查看全部 11 个回答

shuikuliu

金虫 (小有名气)


loovfnd(金币+1,VIP+0):感谢你热心的回答! 4-29 21:27
你用Gview试一下啊,从那里面可以调出坐标系来,应该可以定位吧
闭门造车对搞科研是要不得的,虫友们多多交流啊
2楼2009-04-29 15:04:00
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-30 13:36
弄几个虚原子吧,方便定位。
莫强求!
4楼2009-04-29 19:14:54
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zjy1818

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by shuikuliu at 2009-4-29 15:04:
你用Gview试一下啊,从那里面可以调出坐标系来,应该可以定位吧

我知道Gview可以调出坐标,可是它只能改变一个原子位置,其他原子无法同时移动。 比如我有一个已经优化好的分子,然后我要将这个分子移到我要的精确坐标,难道我要一个一个算出来,一个一个原子输入? 我知道鼠标可以移,但不精确!!!!!!
5楼2009-04-30 17:38:55
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