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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】【求助】gaussian 原子定位问题！！！
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zjy1818

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】gaussian 原子定位问题！！！

gaussian 里是否可以设定一个原子的精确坐标，然后其他原子跟着一块动，而且保持原来构型，我知道鼠标可以，但鼠标无法精确定位，而如果一个个输入原子坐标太麻烦了
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1楼 2009-04-29 13:03:05
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-5 08:29
引用回帖:
Originally posted by zjy1818 at 2009-4-30 17:38:


我知道Gview可以调出坐标，可是它只能改变一个原子位置，其他原子无法同时移动。 比如我有一个已经优化好的分子，然后我要将这个分子移到我要的精确坐标，难道我要一个一个算出来，一个一个原子输入？ 我知道 ...

高斯输出文件中的坐标都是以分子的重心为原点的(就是那个standard orientation)，因此你要把这个分子移动到某个点上，只需要把这个点的xyz坐标分别加到每个原子的xyz坐标上，这样分子的重心就落到了这个点上，分子结构是保持不变的。加的过程用excel就很容易实现的！

[ Last edited by hairan on 2009-5-4 at 19:12 ]
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
7楼2009-05-03 21:25:03
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shuikuliu

金虫 (小有名气)
★
loovfnd(金币+1,VIP+0):感谢你热心的回答！ 4-29 21:27
你用Gview试一下啊，从那里面可以调出坐标系来，应该可以定位吧
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闭门造车对搞科研是要不得的，虫友们多多交流啊
2楼2009-04-29 15:04:00
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-30 13:36
弄几个虚原子吧，方便定位。
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莫强求！
4楼2009-04-29 19:14:54
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zjy1818

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by shuikuliu at 2009-4-29 15:04:
你用Gview试一下啊，从那里面可以调出坐标系来，应该可以定位吧

我知道Gview可以调出坐标，可是它只能改变一个原子位置，其他原子无法同时移动。 比如我有一个已经优化好的分子，然后我要将这个分子移到我要的精确坐标，难道我要一个一个算出来，一个一个原子输入？ 我知道鼠标可以移，但不精确！！！！！！
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5楼2009-04-30 17:38:55
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