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冻冻2007

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】VASP 中晶格参数的优化问题

大家好,我在利用VASP程序做周期性碳纳米管结构优化的时候,希望只优化管轴z方向的晶格参数,其它两个方向的晶格参数,请问如何能够达到这个目的?谢谢!

[ Last edited by wuchenwf on 2009-6-23 at 20:07 ]
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冻冻2007

铜虫 (小有名气)

谢谢你, 不过我想问的是如何选择性优化晶格常数,而不是选择性的优化原子的坐标。具体我想做这样一件事情:建立一个周期性的碳纳米管,这个管子是放在一个晶格常数为a*b*c的超单胞中,为了优化碳管在轴向的晶格常数,我希望固定a,b只优化c,我不知道在VASP中是如何实现的?
3楼2009-04-27 20:35:39
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wangle_xq

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
wuli8(金币+3,VIP+0):感谢交流!(*^__^*) …… 4-27 20:53
没人回答啊?这个不难。在POSCAR中第7行添加 Selective Dynamics 选项
然后为每一个原子位置后面添加具体的变化参数。T表示可变,F表示固定。这个设定在手册中的POSCAR环节有提到。

例如
  0.0000 0.0000 0.5000 F F T
即可表示x,y方向固定,z方向可变。

lz可以再看看手册。上面的说明更重要。

[ Last edited by wangle_xq on 2009-4-27 at 20:20 ]
网络日志 http://blog.163.com/wangle_xq/ 关注计算材料科学的应用,以及相关的计算机技术。文章以转贴为主,少量原创。欢迎参观
2楼2009-04-27 20:17:21
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wangle_xq

银虫 (小有名气)

★ ★
zxzj05(金币+2,VIP+0):3Q! 期待更多讨论! ^_^ 4-28 18:31
我没有做过碳管,冒然上来答题可能不太合适吧。呵呵。
我现在还不是很明白你的意思,可以讨论一下。

据我了解,如果要计算一个碳管,那么首先你需要建立一个含有真空层的超晶胞。通常这个真空层应该是处于x,y面。而z轴方向上应该就是周期性扩展的碳纳米管。是这样么?(如果这步都错了,那请忽略以下所说。不好意思)

如果是这样,那么LZ所说的a×b×c的超晶胞应该就是我上面讲的,a表示x轴方向的晶胞大小,b表示的是y轴的晶胞大小。在x,y轴包含真空层的前提下,我认为,这个a,b的大小没有实际的意义。原因是,VASP的计算是包括周期性边界条件的,这个条件不能去除。为了可以计算碳管,一般的处理原则是选择足够大的真空层,保证在周期性条件下,超晶胞内的碳管不会对晶胞外产生影响。所以,我觉得改变a,b的想法本身值得讨论。

另外,lz希望优化c,也就是z轴方向的大小这点还是比较容易理解的。据我所知VASP当中的确没有这方面的设定。INCAR中的ISIF参数和超晶胞设定相关,但是只是规定体积是否可变,原子是否可变等等,并不满足楼主要求。如果楼下有人知道如何计算,我也是很想知道的。
网络日志 http://blog.163.com/wangle_xq/ 关注计算材料科学的应用,以及相关的计算机技术。文章以转贴为主,少量原创。欢迎参观
4楼2009-04-27 22:11:30
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冻冻2007

铜虫 (小有名气)

谢谢你的回帖,也很高兴能就这个问题给你讨论一下:
首先呢,你说的我都同意。
其次,我知道在VASP中,ISIF参数设定了结构优化的尺度(原子坐标,晶格体积,晶格形状),我想优化晶格参数,所以一般ISIF要取3(原子坐标,晶格体积,晶格形状都优化)。但是为了保证相邻的碳管之间没有相互作用,所以优化晶格形状和体积的时候我不希望a,b变化,我只希望优化c。
编一个脚本文件,设置几个c的值可以得到能量最低的结构,但是这种方法计算量大,每变一个c的值都要结构优化一次,所以我想问一下大家VASP中有没有什么特殊的设置。
5楼2009-04-28 10:37:26
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